1 第一个要给大家讲的, 是它这个 flowcell
Flowcell 翻成中文,就叫“流动池”
我们来看这个图片
图片当中, 我们看到一个象载玻片大小的芯片
这个芯片里面,是做了 8 条通道
在这个通道的内表面,是做了专门的化学修饰
它的化学修饰,主要是用 2 种 DNA 引物,把它( 2 种 DNA 引物)种在玻璃表面
这两种( DNA 引物的)序列是和接下来要测序的DNA 文库的接头序列相互补的
而且这 2 种引物是通过共价键,连到Flowcell 上去
之所以要用共价键连到 Flowcell 上去,是因为接下来有大量的液体要流过这个Flowcell ,只有有共价键连接的这些 DNA ,才不会被冲掉
这就是Flowcell
文库制作再接下来,讲一下文库、和文库的制作(过程)所谓的 DNA 文库,实际上是许多个DNA 片段,在两头接上了特定的DNA 接头,型成的 DNA 混合物
文库有 2 个特点,第 1 个特点,是当中这一段插入的DNA ,它的序列是各种各样的
第 2 个特点,它的两头的接头序列, 是已知的,而且是人工特地加上去的
要做这个文库,首先是把基因组DNA ,用超声波打断
然后打断之后,两头用酶把它补平,再用 Klenow 酶在 3’端加上一个 A 碱基
然后,再用连接酶把这个接头给连上去
连好了接头的 DNA 混合物,我们就称为一个 “文库”
英文也称作 “library ”
桥式 PCR做好了 Library 之后,就要做桥式PCR 了
桥式 PCR,实际上是把文库种到芯片上去,然后进行扩增,这样的一个过程
这个过程,首先是把文库加入到芯片上,因为文库两头的DNA 序列,和芯片上引物是互补的,所以,就会产生互补杂交
2 杂交完了之后,我们在这里面加入dNP 和聚合酶
聚合酶会从引物开始,延着模板合成出一条全新的DNA 链来
新的这条链,和原来的序