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1 第一个要给大家讲的, 是它这个 flowcell 。Flowcell 翻成中文,就叫“流动池”。我们来看这个图片。 图片当中, 我们看到一个象载玻片大小的芯片。这个芯片里面,是做了 8 条通道。 在这个通道的内表面,是做了专门的化学修饰。它的化学修饰,主要是用 2 种 DNA 引物,把它( 2 种 DNA 引物)种在玻璃表面。这两种( DNA 引物的)序列是和接下来要测序的DNA 文库的接头序列相互补的。而且这 2 种引物是通过共价键,连到Flowcell 上去。之所以要用共价键连到 Flowcell 上去,是因为接下来有大量的液体要流过这个Flowcell ,只有有共价键连接的这些 DNA ,才不会被冲掉。这就是Flowcell 。文库制作再接下来,讲一下文库、和文库的制作(过程)所谓的 DNA 文库,实际上是许多个DNA 片段,在两头接上了特定的DNA 接头,型成的 DNA 混合物。文库有 2 个特点,第 1 个特点,是当中这一段插入的DNA ,它的序列是各种各样的。第 2 个特点,它的两头的接头序列, 是已知的,而且是人工特地加上去的。要做这个文库,首先是把基因组DNA ,用超声波打断。然后打断之后,两头用酶把它补平,再用 Klenow 酶在 3’端加上一个 A 碱基。然后,再用连接酶把这个接头给连上去。连好了接头的 DNA 混合物,我们就称为一个 “文库”。英文也称作 “library ”。桥式 PCR做好了 Library 之后,就要做桥式PCR 了。桥式 PCR,实际上是把文库种到芯片上去,然后进行扩增,这样的一个过程。这个过程,首先是把文库加入到芯片上,因为文库两头的DNA 序列,和芯片上引物是互补的,所以,就会产生互补杂交。2 杂交完了之后,我们在这里面加入dNP 和聚合酶。聚合酶会从引物开始,延着模板合成出一条全新的DNA 链来。新的这条链,和原来的序列是完全互补的。接下来,我们再加入NaOH 碱溶液。 DNA 双链在 NaOH 碱溶液存在下,就解链了。而且被液流一冲,原来的那个(模板)链,也就是没有和芯片共价连接的链,就被冲走了。而和芯片共价连接的链,就被保留下来。然后,我们再在液流池里加入中性液体,主要是为了中和这个碱液, 在加入中和液之后,整个环境变成中性了。这时侯,DNA 链上的另外一端,就会和玻璃板上的第二种引物,发生互补杂交。接下来,我们加入酶和dNTP ,聚合酶就延着第二个引物,合成出一条新链来;然后,我们再加碱, 把 2 条链解链解开; 然后,我们再加中和液, 这时侯, DNA...

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