精品文档---下载后可任意编辑一种基于能量和结构的 microRNA 成熟体预测方法的开题报告一、讨论背景MicroRNA （miRNA）是一类在哺乳动物细胞中广泛存在的 30 ~ 22 个核苷酸的非编码 RNA 序列，可以通过与靶基因 mRNA 的互补结合控制靶基因的表达，是细胞内重要的基因调控元件。 miRNA 的成熟过程往往是由特异的核酸内切酶 Dicer 介导的，但是 Dicer 活性的对于成熟体的准确识别具有限制性，时常存在识别精度不高或错误推断的情况，因此构建一个能够准确推断成熟体的预测模型是非常有必要的。目前，已经有许多讨论基于机器学习、深度学习等技术构建了miRNA 成熟体的预测模型，但这些方法往往只基于 miRNA 的序列信息，没有考虑到 miRNA 成熟体的结构和能量特征对于其成熟的影响，因此，在 miRNA 成熟体预测的讨论中引入 miRNA 序列的结构和能量特征，可能对于提高 miRNA 成熟体预测的准确性有较大的帮助。二、讨论目的与意义本讨论旨在通过引入 miRNA 序列的结构和能量特征，构建一种基于能量和结构的 miRNA 成熟体预测模型，并通过比较其在不同数据集上的预测准确性, 分析该模型的优劣之处，对本领域的 miRNA 成熟体预测的相关讨论工作进行探究与丰富，从而为 miRNA 的功能讨论和医学应用提供有价值的参考。三、讨论方法本讨论将主要基于两个方面来构建基于能量和结构的 miRNA 成熟体预测模型，一是 miRNA 序列的二级结构信息，二是 miRNA 序列的自由能信息。对于 miRNA 序列的二级结构信息，我们将采纳基于 RNAfold工具进行预测，采纳 MFE（minimal free energy）的最小值作为miRNA 序列的结构能量信息，而对于 miRNA 序列的自由能信息，我们将采纳 NUPACK 工具进行预测，得到 miRNA 序列的自由能信息。基于以上的能量和结构信息，我们将采纳相关的机器学习方法对于miRNA 序列进行特征提取和分类建模。在进行模型构建时，我们将通过交叉验证等方法，从已有的训练数据集中选择出合适的模型并通过评价指标对于模型的准确性进行评估。四、预期成果精品文档---下载后可任意编辑通过本讨论，我们希望能够构建出一种基于能量和结构的 miRNA 成熟体预测模型，并在不同的数据集上对其进行测试与验证，同时探究分析该模型的优劣之处和其应用前景，从而为基于 miRNA 的讨论工作提供有价值的指导和参考。
