精品文档---下载后可任意编辑三种草坪草 EST-SSR 分子标记开发及利用开题报告一、讨论背景草坪是解决城市绿化问题、增加生态系统功能、改善城市环境的重要途径
草坪草是构成草坪的主要植物,其优良的草丛质量和生态适应性直接关系到草坪的使用效果和生态效益
为了选育更适应我国各地区不同气候、土壤和生态环境的草坪草品种,开展草坪草的分子生物学讨论具有重要意义
EST-SSR(Expressed Sequence Tags-Simple Sequence Repeat),即表达序列标记-简单序列重复,是经过测序的 EST 序列中所含简单重复序列的一部分,具有简单、高效和多态等特点,因此被广泛用于不同物种的遗传多态性分析和分子标记辅助育种
目前,已有讨论对不同种类的草坪草进行 EST 序列测序,但对于 EST-SSR 的开发和利用讨论还不够深化,因此有必要开展进一步的讨论
二、讨论内容本讨论将选择三种草坪草,包括高羊茅(Festuca arundinacea Schred
)、红三叶草(Trifolium pratense L
)和黑麦草(Lolium perenne L
),开展 EST-SSR 分子标记的开发和利用讨论
具体内容如下:1
EST 序列猎取:从 NCBI 数据库中下载三种草坪草的 EST 序列,利用 BioEdit 软件对序列进行编辑和整理
EST-SSR 标记设计:利用 MISA(MIcroSAtellite,微卫星)软件对 EST 序列进行分析,确定三种草坪草 EST 序列中的 SSR 序列,进而设计 EST-SSR 标记
EST-SSR 标记检测:利用 PCR 法对三种草坪草的 EST-SSR 标记进行检测,并对 PCR 产物进行电泳分离和分析
EST-SSR 分子标记利用讨论:将已获得的 EST-SSR 标记用于三种草坪草的遗传多态性分析