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丹参转录组与小RNA组测序分析及动物microRNA簇的进化研究的开题报告

丹参转录组与小RNA组测序分析及动物microRNA簇的进化研究的开题报告_第1页
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精品文档---下载后可任意编辑丹参转录组与小 RNA 组测序分析及动物 microRNA簇的进化讨论的开题报告讨论目的:本讨论旨在利用高通量测序技术对丹参叶片的转录组和小 RNA 组进行测序分析,探究其功能基因和 microRNA 在丹参体内的表达情况和调控机制,并通过对各种物种中 microRNA 簇的进化分析,探究其在物种进化中的作用和保守性。讨论内容:1.采纳低浓度 RNA 样品的总 RNA 和 miRNA 纯化技术,使 RNA 杂质和营养物得到充分去除,保证 RNA 样品的质量和纯度,同时构建高深度、高覆盖的 Illumina 测序文库。2.利用 Illumina HiSeq 平台对丹参叶片进行转录组和小 RNA 组高通量测序,获得高质量的 RNA 数据。3.利用 Bioinformatics 分析软件包处理和分析测序原始数据,对序列进行清理、去重、比对、注释、差异表达分析和功能分类。4.根据转录组和小 RNA 组的分析结果,分别进行 KEGG 代谢通路分析、GO 富集分析、差异表达基因富集分析和小 RNA-mRNA 网络分析。5.结合已有物种中 microRNA 簇的信息,对丹参中的 microRNA 簇进行进化分析和同源性比较,揭示 microRNA 簇在物种进化中的作用和保守性。讨论意义:本讨论将对丹参基因组学和分子生物学的讨论提供重要的参考和借鉴,发掘丹参中的主要功能基因和关键代谢通路,在丹参的栽培和利用中具有重要的意义。同时,通过对各种物种中 microRNA 簇的进化讨论,可深化探究 microRNA 簇在物种演化中的作用和进化规律,为后续的基因组学和生物信息学讨论提供指导和思路。

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