基因组学重点分类修订版(5页)Good is good, but better carries it.精益求精,善益求善。基因组学(Genomics):指以分子生物学技术、计算机技术和信息网络技术为讨论手段,以生物体内全部基因为讨论对象,在全基因背景下和整体水平上探究生命活动的内在规律及其内外环境影响机制的科学。C 值悖理(矛盾)(C-value paradox):在结构、功能很相似的同一类生物中,甚至在亲缘关系十分接近的物种之间,它们的 C 值可以相差数 10 倍乃至上百倍。隔裂基因(split gene):指基因内部被一个或更多不翻译的编码顺序即内含子所隔裂。重叠基因:编码序列彼此重叠的基因。基因内基因:在核基因组中较普遍,常在内含子包含其他基因。反义基因:与已知基因编码序列互补的的负链编码基因,参加基因的表达调控,可以干扰靶基因 mRNA 转录与翻译。克隆重叠群法(clone contig method,作图法测序):以大片段定位的克隆为基础的定向测序战略主要采纳克隆步移法或称重叠群法。这种逐步测序的方法花时间多,但精确。全基因组鸟枪法(whole-genome shotgun method):是随机先将整个基因组打碎成小片段进行测序,最终利用计算机根据序列之间的重叠关系进行排序和组装,并确定它们在基因组中的正确位置。全基因组鸟枪法是一种快速获得真核基因组的方法。遗传作图(Genetic mapping):采纳遗传学分析方法将基因或其它 DNA 序列标定在染色体上构建连锁图。这一方法包括杂交实验,家系分析。遗传图距单位为厘摩(cM), 每单位厘摩定义为 1%交换率。(相对位置)物理作图(Physical mapping):采纳分子生物学技术直接将 DNA 分子标记、基因或克隆标定在基因组实际位置。物理图的距离依作图方法而异,如辐射杂种作图的计算单位为厘镭(cR), 限制性片段作图与克隆作图的图距为 DNA 的分子长度,即碱基对(bp, kb)。(绝对位置)微卫星序列(SSR):或称简单串联重复(STR),重复单位较短。重复序列只有 1-6 个核苷酸,分布在整个基因组,10-50 个重复单位。LOD 值:是指基因连锁可能性的对数,用于初步推断所讨论的 2 个基因是否位于同一染色体上。限制性作图:将限制性酶切位点标定在 DNA 分子的相对位置。重叠群(contig):可以通过末端的重叠序列相互连接形成连续的 DNA 长片段的一组克隆称为重叠群。指纹:指确定 DNA 样品所具有的特定 DNA 片段组成,一个克隆的指纹表示了该克隆所具有的指定序列的特征,可以同其他克隆产生的...