Gel-Proanalyzer的使用流程安装软件后打开，在对话框选择DNAanalysis或者proteinanalysis等OKFileopen打开一张电泳图如下图打开工具栏打开后为如下工具条点击lanesOK自带寻找泳道泳道工具栏添加、移动、查找或者删除泳道等功能点击OK后点击bandsOK打开条带工具栏如下条带工具栏添加、查找或者删除条带等功能去掉不需要的带，加上漏掉的带OK之后，选择M.W.standard选择或者新建marker（如DL2000）再点击Reset再点击elect/Unsel…选择marker泳道OK再点击autolocate结果如图然后选择results得到打开或者新建并打开一个Excel再在以下窗口先选择再FileDDEtoExcel分别有分子大小（根据marker大小计算）、条带亮度相对值对数据进行整理根据亮度及分子大小就可以做柱状图啦分子量大小柱状图亮度大小柱状图至此，作图完毕Gel-Proanalyzer还可以对蛋白胶上的蛋白点（带）进行分析，也还可以对基因芯片点的亮度进行分析，同时还可以对平板上的菌斑进行计数及对菌斑根据大小进行分类统计。这些功能大致也差不多，在此不赘述
