PCR 扩 增 失 败 的 原 因 分析 2010-12-13 16:48:31| 分类: 默认分类|字号 订阅 PCR 扩增失败原因分析,PCR 产物电泳 2010-05-15 16:07 一 模板质量问题: 1)模板提取不完整,其中不含你的目的基因,或目的基因含量太低
可以跑个电泳看看提取的DNA,PCR 阳性样品与阴性样品是否有明显差别
如果确定是这种问题,可以增加模板量试试,但不一定行得通
2)模板里面残留某种试剂成份,可能抑制 Taq 聚合酶的活性,如果是这种情况,可以用试剂盒把模板再纯化一下,或将模板做个梯度稀释以确定最佳的模板量
3) 为什么跑电泳会出现拖带呢
有可能的因为你的电压调的太高了
电泳跟很多因素有关,其中就有一个是电压,在适当的电压范围内增加是可以加快迁移速率,但是要是超到一个临界值反而有害
你可以适当的调低点看看
有时候发现上样量太多的话会有拖带
你看能否回收之后 ,按1:50 或1:100 等稀释后,再当成模板扩一次怎 么样
二 引 物问题 1)样品自 身 的基因型 差异 导 致 扩增失败
也 就是说 你的引 物与某些基因型 的样品结 合的好 ,而和 另 一些 基因型 结 合不好
可以换 一对 更 保 守 的引 物试试
2)普 通 PCR 所 用的一对 引 物中有一个引 物加多了,为正 常 的三 倍只 要引 物特 异 性比 较 好 ,那 么不会产生 大 的影 响
如果恰 巧 是加多的这条 引 物不是很特 异 的话,也 许 会扩出来 非 特 异 带
在制备 单 链 探 针 时候就采 取这样的不对 称 pcr,没 关系 的 三 Taq 酶处 于 失活状 态
因为活性降 低了能出现二 聚体
tap 酶种类 高特 异 性 Taq 酶 高度特 异 性地 扩增所 需 的片 段 是 PCR 最基本 的要求 ,影