如何用Origin 拟合标准曲线并计算IC50? 在之前的日志中讲了一下IC50 的定义,也从网上找了个IC50 计算器让大家使用。 但实际上在计算IC50 的同时,我们一般也要标准曲线,还要线性方程。所以还是用Origin 来拟合标准曲线,然后用origin 内置功能来计算IC50 比较方便。 这里使用Origin7.5 来作演示。 1. 先随意输入一组数据吧 2. 选中这 2 列数据,然后点左下角的作 scatter 图的图标, 3 . 然后就生成了散点图 4. 点击Analysis 菜单中的Fit Polynomial,在弹出的对话框中,Order 处设为1,这样就是作线性拟合,可能有人问,为什么不直接选择Fit Liner 呢?因为只有选Fit Polynomial, 才能在图形上显示公式,也就是勾选对话框中的Show Flormula on graph。(可能Origin 的设计者认为线性拟合公式太简单,默认就不用显示了) 5. 点击OK 后,就得到了拟合后的图形。线性方程公式也显示在了图形上。注意窗口的右下角。 点击那里的小箭头后,我们可以看到完整的拟合统计信息,如相关系数 R2=0.9918 6. 好了,标准曲线知道了,现在就来计算IC50。根据 IC50 定义,该例子中就是 Y 取中值时,X 对应的数值,这里 Y 的中值是 0.6,那根据线性方程就可以自己算出来对应的 X 值。那如果不是线性方程,公式比较复杂手工计算就很麻烦了,所以还是用 Origin 中的功能吧。 点击 Tools,Linear Fit, 如果不是线性拟合的,请选择其他拟合方式,如果是 S 形曲线的,则需要选择Sigmoidal Fit. 7. 在弹出的对话框中,先点击Fit,然后在Find Y 处输入0.6,点击Find X 按钮,得到的数值就是IC50了。同样的可以很方便的求得IC90,IC10,IC20 … Origin 7.5 下载地址: http://cid-60a80badce6f75a5.skydrive.live.com/self.aspx/software/Origin75.rar