生物化学笔记 一蛋白质的共价结构 1.氨基酸（amino acid） －20 个，18 个常见，1 个脯氨酸，1 个硒代胱氨酸（由终止密码字编码） －20 种氨基酸的性质，排列顺序决定蛋白质的性质 －人类中L 型出现较多，D 型较少，但是牙齿中的天冬氨酸便是；而在微生物中，D 型出现较多，一般出现于翻译后修饰，可通过恢复又形成L 型 1．1 氨基酸结构 每个氨基酸（除pro）都含有：－COOH-(羧基)，－NH2－（氨基），—R(R 集团) 羧基和氨基的主要作用：提供氢键形成二级结构 暴露在外的主要是R 基，又侧链的排列组合决定蛋白质的结构 侧链提供不同的功能集团能够使蛋白具有独特性： 独特的折叠结构 溶解状态：与引起生命过程有强烈关系，侧链起决定作用 聚集状态：单体，二聚体等 与大分子物质形成复合物或大分子，提高酶活性 修饰 蛋白质形成的氨基酸规律并不明显，但是结构蛋白有一定的规律，其中有点肯定的是，氨基酸的选择不是随意的 决定蛋白质结构的因素有：氨基酸数量，排列组合，侧链修饰（例如电荷改变与其他分子，自身内部作用而发生改变） 1．2 氨基酸分类（根据极性分类） 在普通条件下，根据极性差别，可分为以下几类： 非极性氨基酸（Gly-G,Ala-A, Val-V, Leu-L, Ile-I, Phe-F, Trp-w, Met-M. Pro-P） 性质：1.具有疏水性 2.结合或放出质子（Met，Phe，Try 易放出质子） 3.酶反应中，蛋白质折叠堆积在一起时，酸性强，从而形成极端环境，因此极性变强，某些基团具有极端性质易完成特定反应。 4.在水相球蛋白中，非极性氨基酸贝排在蛋白质疏水中心，犹如蛋白质骨架，维持蛋白质结构，起稳定作用，蛋白质结构对功能非常重要，因此可在疏水区域对蛋白质骨架与功能有十分重要作用 5.在跨膜蛋白中，非疏水侧链能与膜易结合 1st 甘氨酸（Gly ）： a) 缺少对称结构，不能形成立体化学结构 b) 缺少β 碳原子，因此组成肽链时，使肽链更柔软，因为原子相互之间摆动的角度大，受到阻力比复杂侧链要简单 c) 提供更多的结构空间 d) 甘氨酸常位于蛋白质拐角处，并在胶原蛋白中甘氨酸含量大，提供空间与柔软性，抗击能力强。 e) 甘氨酸对邻位氨基酸也有影响。由于空间小，提供邻位氨基酸化学活性。比如 Asn-Gly的组合比Asn－xaa更易形成环状的酰胺结构 f) 甘氨酸常作为免疫识别和酶催化的位点 2nd 丙氨酸（Ala）： a) 是 20 种氨基酸种最没...
