第一章一、基因组1、基因组(genome):生物所具有的携带遗传信息的遗传物质的总和,是指生物细胞中所有的 DNA,包括所有的基因和基因间区域。2、基因组学:指以分子生物学技术、计算机技术和信息网络技术为研究手段,以生物体全部基因为研究对象,在全基因背景下和整体水平上探索生命活动的在规律及其外环境影响机制的科学。基因组学包括 3 个不同的亚领域结构基因组学(structural genomics) :以全基因组测序为目标功能基因组学(functional genomics):以基因功能鉴定为目标比较基因组学(comparative genomics)二、基因组序列复杂性1、C 值是指一个单倍体基因组中 DNA 的总量,以基因组的碱基对来表示。每个细胞中以皮克(pg,10-12g)水平表示。C 值悖理(矛盾)(C-value paradox):在结构、功能很相似的同一类生物中,甚至在亲缘关系十分接近的物种之间,它们的 C 值可以相差数 10 倍乃至上百倍。C 值反映了总体趋势上,随着生物结构和功能的复杂性的增加,各分类单元中最小基因组的大小随分类地位的提高而递增。2、序列复杂性单一顺序:基因组中单拷贝的 DNA 序列重复顺序:基因组中多拷贝的基因序列真核生物基因组 DNA 组分为非均一性,可分为 3 种类型:快速复性组分、居间复性组分、缓慢复兴组分三、基因与基因家族1、基因家族:是真核基因组的共同特征,他们来自一个共同的祖先,因基因加倍和趋异,产生了许多在DNA 序列上基本一致而略有不同的成员。包括编码 RNA 的基因和编码蛋白质的基因2、隔裂基因(split gene):指基因部被一个或更多不翻译的编码顺序即含子所隔裂。3、异常结构基因分类重叠基因:编码序列彼此重叠的基因,含有不同蛋白质的编码序列。基因基因:一个基因的含子中包含其他基因。反义基因: 与已知基因编码序列互补的的负链编码基因,参与基因的表达调控,可以干扰靶基因mRNA 转录与翻译。4、假基因:来源于功能基因但已失去活性或者改变原来活性功能的DNA 序列.四、基因组特征比较真核生物基因组的特征 :复杂性较高的生物基因组结构松弛,在整个基因组围分布大量重复顺序(小基因组重复序列较少,大基因组重复序列急剧扩增);含有大量数目不等的线性DNA 分子,并且,每个长链 DNA 都与蛋白质组成染色体结构;含有细胞器基因组(所有真核生物都具有环状的线粒体DNA,植物细胞还含有环状的叶绿体 DNA。)原核生物基因组的特征 :原核生物基因数目比真核生物少,大小在 5 Mb 以下;...