天津工业大学毕业论文基于高重复区域基因序列的无模板拼接算法姓 名 徐 ×× 学 院 计算机科学与软件 专 业 软件工程 指导老师 陈 ×× 职 称 副教授 2013 年 5 月 27 日天津工业大学毕业论文任务书题目基于高重复区域基因序列的无模板拼接算法学生姓名徐××学院名称计算机科学与软件专业班级软件××课题类型实际课题课题意义利用全基因组无模板拼接技术，可以获得动物、植物、细菌、真菌的全基因组序列，从而推动该物种的讨论。一个物种基因组序列图谱的完成，意味着这个物种学科和产业的新开端，这也将带动这个物种下游一系列讨论的开展。全基因组序列图谱完成后，可以构建该物种的基因组数据库，为该物种的后基因组学讨论搭建一个高效的平台，为后续的基因挖掘、功能验证提供 DNA 序列信息，为疾病、癌症等的讨论提供真实有效的数据。任务与进度要求2025.2.20-2025.3.11 选题确认并完成开题报告、任务书的填写、提交、 审核2025.3.12-2025.3.26 深化了解课题内容、算法分析、确定算法系统框架、熟悉开发工具2025.3.27-2025.5.3 完成算法的逻辑实现，和算法工具包的开发，完成算法系统的大部分功能，初稿完成2025.5.4-2025.5.21 进行实验结果整理，并在整理中进一步提高拼接序列的的各项指标，二稿完成2025.5.22-2025.6.5 毕业论文的审核、修改及定稿并装订2025.6.6答辩主要参考文献 [1]Bresler, M., Sheehan, S., Chan, A.H., and Song, Y.S. Telescoper: De novo Assembly of Highly Repetitive Regions. ECCB'12 Special Issue, Bioinformatics[J]. 2025,28 i311-i317 [2]MacCallum,I. et al. ALLPATHS 2: small genomes assembled accurately and with high continuity from short paired reads[J]. Genome Biol. 2025, 10, R103 [3]Simpson,J.T. et al. ABySS: a parallel assembler for short-read sequence data[J]. Genome Res. 2025, 19, 1117–1123 [4]Zerbino,D.R. and Birney,E. Velvet: algorithms for de novo short-read assembly using de Bruijn graphs[J]. Genome Res. 2025, 18, 821–829 [5]Li,R. et al. De novo assembly of human genomes with massively parallel shortread sequencing[J]. Genome Res. 2025, 20, 265–272起止日期2013 年 2 月 25 日至 2013 年 6 月 6...
