临床基因检测试验室建设要求VIP专享VIP免费

临检实验室建设标准与要求一、高通量测序（NGS）实验室简介1.1NGS实验室又叫高通量测序检测实验室。NGS是下一代测序技术(NEXTGENERATIONSEQUENCING)即高通量测序技术的简称。高通量测序技术是对传统SANGER测序（称为一代测序技术）革命性的改变,可同时对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定，同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,也称为深度测序(DEEPSEQUENCING)。1.2由于NGS技术对所检测的核酸模板进行大量扩增，容易出现实验室污染致使检测结果准确性下降；另外NGS技术要求高、影响因素多，实验进程处置不妥易致使检测结果准确性下降或检测失败。因此临床基因扩增查验实验室技术验收和规范化管理是NGS技术本身需要，也是在临床上顺利应用该技术前提。二、NGS实验室临床应用的大体条件2.1必需拥有符合临检中心相关规定的标准NGS实验室。2.2检测设备必需符合标准NGS实验室设置要求：高通量测序仪及配套服务器；高通量测序检测试剂盒；通用电脑；自动分析软件，实验室样本信息管理系统等。2.3检测人员必需通过专门的技术培训，并取得省级以上卫生计生行政部门颁发的临床基因扩增查验技术上岗证书。NGS实验室必需成立严格的实验室管理制度、成立标准化操作程序（SOP）、成立系列质量管理文件等，确保实验室日常运行符合国家卫生部的要求，确保检测结果准确、确保实验室卫生安全，确保实验室长期稳定运行。2.4NGS临床应用必需在无菌无尘环境下进行操作。三、NGS实验室建设大体要求3.1主体结构主体为彩钢板、铝合金型材。室内所有阴角、阳角均采用铝合金50内圆角铝，从而解决容易污染、积尘、不易打扫等问题。结构牢固，线条简明，美观大方，密封性好。3.2标准的各区分隔和气压调节将检测进程分成试剂准备、样本制备、PCR扩增和高通量测序四个独立的实验区。整个区域有一个整体缓冲走廊。每一个独立实验区设置有缓冲区，同时各区通过气压调节，使整个检测实验进程中试剂和标本免受气溶胶的污染并降低扩增产物对人员和环境的污染。可打开缓冲区和PCR扩增区的排风扇往外排气，在实验区的外墙上和各扇门上都安装有风量可调的回风口，空气通过回风口向室内换气。3.3消毒在每一个实验区缓和冲区顶部和传送窗内部安装有紫外灯，供消毒用。在各区还设置移动紫外线灯，对实验桌进行局部消毒。3.4机械连锁不锈钢传递窗试剂和标本通过机械连锁不锈钢（不建议利用电子连锁方式）传递窗传递，保证试剂和标本在传递进程中不受污染（人物分流）。3.5地面地面建议利用PVC卷材地面或自流坪地面，整体性好。便于进行打扫，耐侵蚀。没有条件的也可采用水磨石地面，或大块的瓷砖（至少800MM×800MM）接缝需要小于2MM。3.6照明灯具要选用净化灯具，能达到便于清洗、不积尘的特点。3.7平面布局NGS实验室应按照自己的查验项目、所采用的检测技术平台和工作量来决定分区的多少及各区域的空间大小，至少具体需要多少个区，一样是“个体化”的，以“工作有序、互不干扰、避免污染、报告及时”作为大体原则。四、各项目实验室建设标准产前筛查与产前诊断（全基因组低拷贝测序技术）1.实验室平面图图1：产前筛查与诊断实验室平面图2.技术流程图图2：产前筛查与诊断技术流程图3.技术参数分区专用走廊缓冲区试剂准备室标本与文库制备区文库扩增与检测区测序区4.分区功能4.1试剂准备室主要功能：在NGS进程中利用到的试剂的配制、分装和保留。4.2标本与文库制备区主要功能：血液处置、血浆制备、DNA提取、DNA片段化、DNA样品的纯化、DNA浓度检测、结尾修复、接头连接、构建样本的测序文库。4.3文库扩增与检测区压力0Pa+5Pa+15Pa+10Pa20-25℃40%~60%主实验室≥300LX，其余房间200～300LX温度相对湿度照明-5Pa-10Pa主要功能：文库构建后的PCR扩增与纯化、文库浓度检测、文库的混合及混合后的质检分析。4.4测序区主要功能：测序模板制备（乳液PCR与磁珠富集回收）、上机测序、数据分析、报告审核及发放。5.仪器配置5.1试剂准备室主要仪器设备：加样器、冰箱、分析天平、微量台式离心机、涡旋振荡器、移液器、可移动紫外灯和超净工作台等。5.2标本与文库制备区主要仪器设备：冷冻离...