《基因组学与蛋白质组学》课程教学大纲学时：40学分：2.5理论学时：400实验学时：面向专业：生物科学、生物技术课程代码：B7700005先开课程：生物化学、分子生物学课程性质：必修/选修执笔人：朱新审定产人：第一部分：理论教学部分一、课程的性质、目的和任务《基因组学与蛋白质组学》是随着生物化学、分子生物学、结构生物学、晶体学和计算机技术等的迅猛发展而诞生的，是融合了生物信息学、计算机辅助设计等多学科而发展起来的新兴研究领域。是当今生命科学研究的热点与前沿领域。由于基因组学与蛋白质组学学科的边缘性，所以本课程在介绍基因组学与蛋白质组学基本基本技术和原理的同时，兼顾学科发展动向，讲授基因组与蛋白组学中的热点和最新进展，旨在使学生了解现代基因组学与蛋白质组学理论的新进展并为相关学科提供知识和技术。二、课程的目的与教学要求通过本课程的学习，使学生掌握基因组学与蛋白质组学的基本理论、基础主要研究方法和技术以及生物信息学和现代生物技术在基因组学与蛋白质知识、．组学上的应用及典型研究实例，熟悉从事基因组学与蛋白质组学的重要方法和途径。努力培养学生具有科学思维方式、启发学生科学思维能力和勇于探索，善于思考、分析问题的能力，激发学生的学习热情，并通过学习提高自学能力、独立思考能力以及科研实践能力，为将来从事蛋白质的研究奠定坚实的理论和实践基础。三、教学内容与课时分配第一篇基因组学学时）1绪论（第一章第一节基因组学的研究对象与任务；第二节基因组学发展的历程；第三节基因组学的分子基础；第四节基因组学的应用前景。本章重点：1.基因组学的概念及主要任务；基因组学的研究对象。2.本章难点：1.基因组学的应用及发展趋势；2.基因组学与生物的遗传改良、人类健康及生物进化。建议教学方法：课堂讲授和讨论思考题：查阅有关资料，了解。基因组学的应用发展第二章（1学时）人类基因组计划人类基因组计划的诞生；第一节人类基因组研究的竞赛；第二节第三节人类基因组测序存在的缺口；第四节人类基因组中的非编码成分；人类基因组的概观；第五节人类基因组多样性计划。第六节本章重点：1.人类基因组的研究；人类基因组多样性。2.本章难点：人类基因组序列的诠释。建议教学方法：课堂讲授和讨论思考题：人类基因组计划有什么重要意义？第三章寻找基因（2学时）第一节从基因组序列鉴定基因；第二节全长cDNA的产生；第三节测序；cDNA全长第四节基因组注释；第五节利用诱变确定基因。本章重点：1.从基因组序列鉴定基因；2.基因组注释。本章难点：从基因组序列寻找和鉴定基因。建议教学方法：课堂讲授和讨论思考题：如何从基因组序列寻找和鉴定基因？第四章结构基因组学（3学时）第一节遗传作图；第二节物理作图；第三节转录本图；第四节基因组测序与序列组装；第五节基因组序列诠释。本章重点：1.基因组测序与序列组装；转录本图。2.本章难点：基因组序列的诠释。建议教学方法：课堂讲授和讨论思考题：试述基因组测序与序列组装的基本原理。第五章功能基因组学（3学时）第一节转录组学；第二节蛋白质组学；第三节表型组学；第四节外遗传现象及其分子机制。本章重点：1.转录组学；2.蛋白质组学。本章难点：功能基因组的诠释。建议教学方法：课堂讲授和讨论思考题：试述功能基因组学的意义及核心技术。第六章比较基因组学（2学时）第一节基因共线性；第二节直系同源物；第三节异系同源；第四节超基因家族；第五节基因预测。本章重点：1.基因共线性；2.超基因家族。本章难点：基因的预测。建议教学方法：课堂讲授和讨论思考题：试述比较基因组学的意义及核心技术。第七章进化基因组学（2学时）第一节进化的分子基础；第二节基因的突变；第三节基因的重复；第四节基因簇；第五节基因岛与协同进化；第六节非编码DNA与基因组进化。本章重点：1.基因的突变；2.基因簇。本章难点：非编码DNA与基因组进化。建议教学方法：课堂讲授和讨论思考题：试述进化基因组学的意义及核心技术。第八章测序的策略（3学时）第一节链终止法；第二节化学降解测序；第三节鸟枪法；第四节克隆重叠群；第五节EST测序；第六节全基因组的测序；第七...
