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Northern Blot原理及实验方法VIP免费

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NorthernBlot原理及实验方法原理:在变性条件下将待检的RNA样品进行琼脂糖凝胶电泳,继而将在凝胶中的位置转移到硝酸纤维素薄膜或尼龙膜上,固定后再与同位素或其它标记物标记的RNA探针进行反应。用途:检测样品中是否含有基因的转录产物(mRNA)及其含量。实验方法:[仪器、试剂、材料](一)仪器恒温水浴箱,电泳仪,凝胶成像系统,真空转移仪,真空泵,UV交联仪,杂交炉,恒温摇床,脱色摇床,漩涡振荡器,分光光度计,微量移液器,电炉(或微波炉),离心管,烧杯,量筒,三角瓶等。(二)材料总RNA样品或mRNA样品,探针模板DNA(25ng),尼龙膜(三)试剂:NorthernMaxKit(Cat.#1940,Ambion,Inc.),琼脂糖,DEPC,X光底片,底片暗盒,RandomPrimer,dNTPMixture,111TBq/mmol[a-32P]dCTP,Exo-freeKlenowFragment和10XBuffer,SephadexG-50,SDS,双氧水,灭菌水等。[方法与步骤]1.用具的准备:180度烤器皿:三角锥瓶、量筒、镊子、刀片等4小时。电泳槽:清洗梳子和电泳槽并用双氧水浸泡过夜,用DEPC水冲洗,干燥备用。处理DEPC水(2L)备用。2.用RNAZaP去除用具表面的RNase酶污染用RNAZap擦洗梳子,电泳槽,刀片等,然后用DEPC水冲洗二次,去除RNAZap。3.制胶:1.称取0.36mg琼脂糖加入三角锥瓶中,加入32.4mlDEPC水后,微波炉加热至琼脂糖完全熔解。60℃空气浴平衡溶液(需加DEPC水补充蒸发的水分)2.在通风厨中加入3.6ml的10*DenaturingGelbuffer,轻轻振荡混匀。注意尽量避免产生气泡。3.将熔胶倒入制胶板中,插上梳子如果胶溶液上存在气泡,可以用热的玻璃棒或其它方法去除,或将气泡推到胶的边缘。注:胶的厚度不能超过0.5cm。4.胶在室温下完全凝固后,将胶转移到电泳槽中,加入1xMOPSGelRunningbuffer盖过胶面约1cm,小心拔出梳子。(配制250ml1×MOPSGelRunningbuffer,在电泳过程中补充蒸发的buffer。)5.检查点样孔。4.RNA样品的制备在RNA样品中加入3倍体积的formaldehydeloaddye和适当的EB(终浓度为10ug/ml)。混匀后,65℃空气浴15min。短暂低速离心后,立即放置于冰上5min。5.电泳:1.将RNA样品小心加到点样孔中。2.在5V/cm下跑胶(5x14cm)。在电泳过程中,每隔30min短暂停止电泳,取出胶,混匀两极的电泳液后继续电泳。当胶中的溴纷蓝(500bp)接近胶的边缘时终止电泳。3.紫外灯下,检验电泳情况,并用尺子测量18S、28S、溴纷蓝到点样孔的距离。注意不要让胶在紫外灯下曝光太长时间。6.转膜1.用3%双氧水浸泡真空转移仪后,用DEPC水冲洗。2.用RNAZap擦洗多孔渗水屏和塑胶屏,用DEPC水冲洗二次。3.连接真空泵和真空转移仪,剪取一块适当大小的膜(膜的四边缘应大于塑胶屏孔口的5mm),膜在Transferbuffer浸湿5分钟后,放置在多孔渗水屏的适当位置。4.盖上塑胶屏,盖上外框,扣上锁。5.将胶的多余部分切除,切后的胶四边缘要能盖过塑胶屏孔,并至少盖过边缘约2mm,以防止漏气。6.将胶小心放置在膜的上面,膜与胶之间不能有气泡。7.打开真空泵,使压强维持在50~58mbar;立即将transferbuffer加到胶面和四周。每隔10min在胶面加上1mltransferbuffer,真空转移2小时。8.转膜后,用镊子夹住膜,于1xMOPSGelRunningbuffer中轻轻泡洗10秒,去除残余的胶和盐。9.用吸水纸吸取膜上多余的液体后,将膜置于UV交联仪中自动交联。10.将胶和紫外交联后的膜,在紫外灯下检测转移效率。(避免太长的紫外曝光时间)12.将膜在-20℃保存。7.探针的制备1.在1.5ml离心管中配制以下反应液:模板DNA(25ng)1ulRandomPrimer2ul灭菌水11ul总体积:14ul2.95°C加热3分钟后,迅速放置于冰冷却5min。3.在离心管中按下列顺序加入以下溶液:10×Buffer2.5uldNTPMixture2.5ul111TBq/mmol[a-32P]dCTP5ulExo-freeKlenowFragment1ul4.混匀后(25ul),37°C下反应30分钟。短暂离心,收集溶液到管底。5.65°C加热5min使酶失活。8.探针的纯化及比活性测定:1.准备凝胶:将1g凝胶加入30ml的DEPC水中,浸泡过夜。用DEPC水洗涤膨胀的凝胶数次,以除去可溶解的葡聚糖。2.取1ml一次性注射器,去除内芯推扞,将注射器底部用硅化的玻璃纤维塞住,在注射器中装填SephadexG-50凝胶。3.将注射...

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