生化—蛋白质-3VIP免费

1蛋白质化学蛋白质化学1.1氨基酸1.2肽1.3蛋白质的分子结构1.4蛋白质结构和功能的关系1.5蛋白质的重要性质1.6蛋白质的分类1.7蛋白质的分离与鉴定蛋白质化学1.3蛋白质的分子结构蛋白质化学一级结构(p41）:氨基酸序列和二硫键的位置二级结构(p57）：主链规律的空间排列(α-螺旋,β-折叠)超二级结构结构域（domain）三级结构(p70）：所有原子空间位置四级结构(p83）：多肽链间的相互关系维持蛋白质空间结构稳定的因素我们将要学到的……蛋白质化学三、蛋白质的超二级结构和结构域1、超二级结构（p71)⑴定义超二级结构是指二级结构的基本结构单位（α-螺旋，β-折叠等）相互聚集，形成有规律的二级结构的聚集体。蛋白质化学：由两股平行或反平行排列的右手螺旋段相互缠绕而成的左手卷曲螺旋。——Keratin(角蛋白p65),myosin(肌球蛋白)：由两段平行折叠股和一段作为连接链的螺旋组成，股之间还有氢键相连。——拥有β-sheet的蛋白质:由一条多肽链的若干段折叠股反向平行组合而成，两个股间通过一个短环连接起来。——拥有β-sheet的蛋白质⑵几种基本的组合形式蛋白质化学β折叠在蛋白质中的不同形式蛋白质化学βαβ在蛋白质中(RossmannRossmannfolding)蛋白质化学蛋白质化学蛋白质化学蛋白质化学蛋白质化学2、结构域（domain，p72）⑴定义：多肽链在二级结构或超二级结构的基础上形成的局部折叠区,是相对独立的紧密球状实体。Polypeptideswithmorethanafewhundredaminoacidresiduesoftenfoldintotwoormorestable,globularunitscalleddomains。⑵特点①最常见的结构域含序列上连续的100～200个氨基酸残基，少至40个左右，多至400个以上。②结构域是多肽链的独立折叠单位。蛋白质化学例如蚯蚓血红蛋白：由四个α-螺旋组成的结构域木瓜蛋白酶：含有两个不同的结构域肌钙蛋白C蛋白质化学(3)意义结构域往往有特殊的功能，例如结合小分子。含多结构域的蛋白质中，小分子结合部位往往出现在两个域之间的裂缝处。对于较小的球状蛋白质分子或亚基来说，结构域和三级结构是一个意思。蛋白质化学四、球状蛋白质的三级结构p70（tertiarystructure）三级结构是蛋白质分子中所有原子的三维空间排列，包括它的二级结构要素和它的侧链在空间上的相互关系。Theoverallthree-dimensionalarrangementofallatomsinaproteinisreferredtoastheprotein’stertiarystructure.主要研究方法是X-光衍射和核磁共振法。1、定义蛋白质化学β-折叠β-转角无规则卷曲空穴β-折叠β-转角无规则卷曲空穴2、球状蛋白质的特征鸡卵清溶菌酶的三级结构含多种二级结构单元有明显的折叠层次是紧密的球状或椭球状实体分子表面有一空穴(活性部位)疏水侧链埋藏在分子内部，亲水侧链暴露在分子表面。α-螺旋蛋白质化学细胞色素C核糖核酸酶溶酶体红色——血红素(细胞色素c)和活性部位(溶酶体和核糖核酸酶)黄色——二硫键蛋白质化学抹香鲸肌红蛋白的立体结构表示法（三级）多肽骨架（丝带法，二级结构）“网眼”图(蛋白质表面)表面轮廓图(观察凹穴)丝带法(包括侧链)立体模型(包括侧链)疏水残基血红素蛋白质化学由124个氨基酸残基组成多肽链折叠形成3个-螺旋、6个-折叠片以及一些-转角和无规则卷曲二级结构再组合形成近似卵圆的结构表面有一个凹陷，构成酶活性中心的3个氨基酸残基就集中于此3、实例核糖核酸酶肌红蛋白由一条多肽链和一个辅基血红素构成含153个氨基酸残基分子中多肽链由长短不等的8段直的-螺旋组成拐弯是由1～8个残基组成的无规卷曲C-末端有一段5残基的松散肽链分子致密结实，内部只有一个能容纳4个水分子的空间亲水的氨基酸几乎全分布在分子的表面，而疏水的残基几乎全被埋在分子内部蛋白质化学血红素(Heme)是铁卟啉化合物，由4个甲炔基相连成为一个环形，Fe2+居于环中。铁离子有6个配位键，其中4个与吡咯环的N配位结合，1个配位键和肌红蛋白的93位(F8)组氨酸残基结合，氧则与Fe2+形成第6个配位键，接近第64位(E7)组氨酸。蛋白质化学血红素(Heme)是铁卟啉化合物，由4个甲炔基相连成为一个环形，Fe2+居于环中。铁离子有6个配位键，其中4...