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第一章 蛋白质的结构和功能构型:指在立体异构体中取代原子或基团在空间的取向。构型的改变涉及共价键的破裂和重建。 构象(conformation):指构成分子的原子和基团因为化学键的旋转而形成在三维空间上不同的排布、走向。构象的改变不涉及共价键的破裂,仅涉及氢键、疏水键等次级键的变化 一级结构 :指多肽链中氨基酸的排列顺序。稳定因素:肽键二级结构:多肽链的某一段肽链中,邻近氨基酸残基之间,通过氢键形成的有规则重复的(α-螺旋和 β-折叠)、部分有规则的(β-转角和 Ω 环)或无序结构的一种局部构象。二面角(构象角) 连结两个相邻肽平面的 Cα 产生的角。二面角决定了两个相邻肽平面的空间相对位置。二级结构与一级结构的关系:各种氨基酸残基在不同的二级结构中出现的频率不同 a. 形成 α-螺旋能力强的氨基酸有:Glu、Met、Ala、Leu b. 形成 β-折叠能力强的氨基酸有:Val、Ile、Tyrc. 形成 β-转角能力强的氨基酸有:Pro、 Gly、Asn、Asp、Ser;此外,多肽链中若存在连续酸性或碱性的氨基酸残基时,因同电相斥也影响构象的形成,所以,多肽链的 R 侧链的位置、大小、极性、荷电情况等,最终决定蛋白质二级结构的形成。超二级结构:相邻的几个二级结构相互作用形成有规则的组合体,是特殊的序列或结构的基本组成单元,又称为基序或模体。αα(EF hand;Leucine zipper)ββ、βαβ。结构域:超二级结构进一步组合折叠成半独立紧密的球状 类型:1,平行 α/β 型 2,反平行 β-型 3,全 α-型 4,小的不规则结构 三级结构:在二级结构,超二级结构及结构域基础上,一级结构相隔较远的氨基酸残基以次级键相连,盘旋折叠成球状,形成包括主链和侧链在内所有原子和基团的特定空间排布稳定因素:侧链 R 基团之间相互作用形成的各种非共价键,包括疏水键、氢键、离子键和范德华力等。四级结构:多亚基蛋白的各亚基的相对空间排布及亚基间的相互作用,维系力主要是疏水作用力、氢键和离子键等次级键。HB变性(denaturation):物理化学因素使蛋白质的理化性质变化,生物学功能降低或丧失,其实质是破坏维系蛋白质空间构象的次级键,但不涉及肽键的断裂。复性:将蛋白质从结构不规则、无活性的状态,恢复到有唯一立体结构、有生物活性的状态的过程。同源蛋白质(homologus protein)执行同一种功能的蛋白质在进化过程中可能来自同一祖先。分子病 结构异常(镰刀状细胞贫血); 分子减少或缺失(蚕豆病)构象...

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