近来研究ROC，有一点心得，也有一个疑问。 ROC 曲线理论 以真阳性率（灵敏度）为纵坐标，假阳性率（1—特异度）为横坐标绘制。 各种作图软件的比较、软件的下载安装、作图的具体步骤： （1）Excel 做的散点图：（由于我们经常使用 Excel，所以开始时觉得这个方法较容易接受。但由于Excel 毕竟不是做 ROC 曲线的专用工具，所以需要自己算出敏感度和特异度，而且无 ROC 曲线的分析。） 这个方法要算出相应的敏感度和 1-特异度的值，然后选中数据区，做散点图，只是做参照线（也就是对角线）的时候，有点麻烦，因为Excel 的线性拟合的截距不是 0，改为0 后，斜率不是 45°，而且没有相应的点，所以我是用了小聪明，拷贝了两列特异度作为数据源，在原来的散点图中添加数据，画的参照线。 （2）Spss15.0 作图结果：（只能进行 ROC 曲线下面积 AUC 的非参数估计，以及找出最佳工作点，使用该软件的感觉有点像 matlab，有两个窗口，个人感觉该软件功能很强大，只是软件的下载很费事，要下载相应的算号器。在安装的过程中，使用算号器破解。) 1:建立数据表（File—>new—>data）输入数据，数据表的界面如图二，可以在 data view（修改数据的数值） 和 variable view（修改数据的类型）之间切换。 2:Analyze—>ROC Curve—>Test Variable(选择你的测试值，可以有多个，本例为test1、test2、和test3 的比较，故选择3 个值)，State Variable(选择测试结果值，本例为diagnosis) Value State（判断正确的取值，本例为1 ） Disply 的选项全选。在 Output 窗口可以得到如图所示的曲线。 medcalc 作图的结果：（该软件的界面很友好，比spss 好用，分析功能强大，有详细的ROC 曲线的report，作出来的图也很漂亮，双击图像可以对图的显示效果做调整，只是每次使用该软件，第一次点击显示不能使用该软件，第二次要输入：MedCalc sn:User name : Jodi Hodnik Product key: 9SPP9-WA699-KY8MK-565PF 才可以使用。 1：建立数据表：（和 spss 类似） 2：Statistics—>ROC Curve—>ROC Curve analysis(画一个结果的ROC 曲线) 或者 Comparison of Curves(多个结果的比较) 疑问： 在蛋白质分类的预测结果中test 这一列的取值是什么？？ 为研究这个问题，我做了以下的ROC 曲线：（ROC 也算是了解了，希望可以用到我的论文中，蛋白质预测的最终能得到一列和 test这一列同样性质的值吗？？？） （...
