理论免疫学研究进展【摘要】理论免疫学用数学的办法来研究和解决免疫学问题，以及对免疫学有关的数学办法进行理论研究的一门科学。随着高通量办法和基因组数据的出现，理论免疫学从受体交联和免疫原理、Jerne 的互相作用网络和自我选择等典型建模办法开始向信息学、空间扩展模型、免疫遗传学和免疫信息学、进化免疫学、分子生物信息学和表遗传学、高通量研究办法和免疫组学等方面转变。【核心词】免疫学, 理论；数学模型；生物数学Advances of theoretical immunologyJIN Yan【Abstracts】Theoretical immunology is to develop mathematical methods that help to investigate the immunological problems, and to study the mathematical theory on immunology. With the advent of high-throughput methods and genomic data, immunological modeling of theoretical immunology shifted from receptor cross linking, Jerne interaction networks and self-non self selection, toward the informatics, spatially extended models, immunogenetics and immunoinformatics, evolutionary immunology, innate immunity and epigenetics, high-throughput research methods and Immunomics. Immunology, Theoretical; Mathematical Models; biomathematics 理论免疫学[1]（Theoretical Immunology）是指用数学的办法来研究和解决免疫学问题，以及对免疫学有关的数学办法进行理论研究的一门科学。理论免疫 学 是 免 疫 学 与 数 学 交 叉 的 边 沿 学 科 ， 也 称 数 学 免 疫 学 （ Mathematical Immunology），是生物数学的一种分支。由于免疫现象复杂，从免疫学中提出的数学问题往往也十分复杂，需要进行大量计算工作，因此从近年兴起的复杂系 统 研 究 的 角 度 来 讲 [2] ， 理 论 免 疫 学 也 称 复 杂 免 疫 学 （ Complex Immunology）。理论免疫学的任务就是揭示免疫系统运行的规律和机制，及其病理机制。数学模型（Mathematical Models）和数据分析是理论免疫学的重要办法，计算机是研究和解决理论免疫学问题的重要工具。即使从上个世纪中期，数学模型已经开始应用于免疫学，但传统的模型大部分是基于微分方程[3]、差分模型和元胞自动机（Cellular Automata）[4]。这些传统模型以少数成分（一...
