序列分析软件DNAMAN的使用方法简介

序列分析软件DNAMAN 的使用方法简介 吕惠平 (新疆大学生命科学与技术学院；新疆生物资源基因工程重点实验室，乌鲁木齐，830046) DNAMAN 是一种常用的核酸序列分析软件。由于它功能强大，使用方便，已成为一种普遍使用的DNA 序列分析工具。本文以 DNAMAN 5.2.9 Demo version 为例，简单介绍其使用方法。 打开 DNAMAN，可以看到如下界面： 第一栏为主菜单栏。除了帮助菜单外，有十个常用主菜单，第二栏为工具栏： 第三栏为浏览器栏： 在浏览器栏下方的工作区左侧，可见 Channel 工具条，DNAMAN 提供 20 个 Channel，(如左所示：)点击 Channel 工具条上相应的数字，即可击活相应的Channel。每个 Channel 可以装入一个序列。将要分析的序列（DNA 序列或氨基酸序列）放入 Channel 中可以节约存取序列时间，加快分析速度。此版本 DNAMAN 提供自动载入功能，用户只需激活某个 Channel，然后打开一个序列文件，则打开的序列自动载入被激活的 Channel 中。 本文以具体使用DNAMAN 的过程为例来说明如何使用DNAMAN 分析序列。 1．将待 分析序列装入 Chan n el （１ ）通 过File Open 命令 打开待 分析序列文件，则打开的序列自动装入默 认Channel。（初 始 为 channel1）可以通 过激活不 同 的channel (例如：channel5)来改 变 序列装入的Channel。（２ ）通 过Sequ ence/Load Sequ ence菜单的子菜单打开文件或将选定的部分序列装入Channel 。 通 过Sequ ence/Cu rrent Sequ ence/Analy sis Defination 命令打开一个对话框，通过此对话框可以设定序列的性质（DNA 或蛋白质），名称，要分析的片段等参数。 2． 以不同形式显示序列 通过 Sequ ence//Display Sequ ence 命令打开对话框，如下图所示： 根据不同的需要，可以选择显示不同的序列转换形式。对话框选项说明如下： Sequ ence &Composition 显示序列和成分 Rev erse Complement Sequ ence 显示待分析序列的反向互补序列 Rev erse Sequ ence 显示待分析序列的反向序列 Complement Sequ ence 显示待分析序列的互补序列 Dou ble Stranded Sequ ence 显示待分析序列的双链序列 RNA Sequ ence 显示待分析序列的对应 RNA 序列 3．D N A 序列的限制性酶切位点分析 将待分析的序列装入Channel，点击要分析的Channel，然后通过 Restriction/Analy sis 命令打开对话框，如下所示： ...