rcos 为了能准确地画出染色体示意图，染色体的定义，位置，大小，以及显示的形式都是circos 需要考虑的
这些要素需要在数据文件当中定义出来
数据结构 染色体组型(karyotypes)是一类特殊的数据
一般的，它保存在名为xx
karyotype
txt文件当中
它将定义染色体的大小，ID，名称和颜色
每一行一条染色体，格式如下： chr - ID LABEL START END COLOR 最开始的chr 表示，这一行将定义一个染色体
然后是一个短线占位符
这个占位符通常用来定义所属关系，对于染色体来说，没有所属
ID 是染色体唯一且不能重复的标识
之后的LABEL 是将来用于显示在图上的文本
如果一个染色体组型文件里面包含多个不同来源的染色体组，设置ID 最好的办法就是使用前缀
比如 hs=homo sapiens, mm=mus musculus 等等
有时候你可以使用hs19 做为前缀来明示数据来源版本
其实，即使是只有一个来源的染色体组，也最好使用前缀，以规范文件格式
START 和 END 值定义了染色体的大小
对于染色体组型文件，需要指明的是，这里的START 和END 应该是染色体本身的大小，而不是你想绘制部分的起止位置
指定绘制部分将由其它文件来定义
COLOR 是于定义显示的颜色
如果染色体组不以条纹(cytogenetic bands)图谱覆盖的话，那么就会以这里设置的颜色显示
对于人类基因组而言，circos 预设了与染色体相同的名字做为颜色名，比如 chr1, chr2, … chrX, chrY, chrUn
下面就是hg19 的例子： chr - hs1 hs1 0 249250621 chr1 chr - hs2 hs2 0 243199373 chr2 chr - hs3 hs3 0 198022430 chr3 chr -
