分析测量图象软件 Imagepro-Plus教程 入门 Image pro-plus(IPP)的主要用途是分析测量图像
本人使用该程序进行生物图象分析有一段时间,写此帖的主要目的还是与大家交流使用心得,并总结一下使用方法
如果你是刚接触 IPP,最好先从本帖看起,并同时打开电脑上的 IPP 程序照着操作
学会一个软件需要花一段时间的,两分钟不可能学会
两小时也太短
但我相信,照着我这几个帖子作下来,至少是可以用 IPP 干一点事情了
既然是处理图片,当然是先要打开一张要处理的图片嘛 这张照片中的黄色部分是免疫组化染色的阳性表达成分
处理目标是通过测量图片中黄色部分的"黄"度来反映相应蛋白表达的“量”
对图片进行观察,可以看到图片中主要有三种主要颜色,一是染成蓝色的细胞核,二是呈现出黄色的胞浆,三是细胞间的空隙区域,呈现出浅蓝色,是为背景
所以首先要把图片中呈现黄色的区域给挑选出来,这部分区域是我们最感兴趣的地方,叫做AOI(area of interest)
AOI 是 IPP 中最有用最重要的概念
如何能够准确地选取 AOI 就是使用 IPP 的关键操作
一旦准确地选取了 AOI,下面的测量分析就好办了
对不同的图片,需灵活地使用各种适当的 AOI 工具,就这张图片来说,AOI 是黄色区域,因此用颜色分类的 AOI 工具是最有效的
点击 measure---count/size,弹出分类测量窗口,在窗口中选中 manual,再点击 select color,弹出颜色选择窗口 segmentation,这个工具是 IPP 最有特色的颜色选取工具之一
用好这个工具是使用 IPP 的要点
对于目标颜色鲜明的图片,用吸管工具是最简单的
点一下吸管图标,在目标区域点一下,就可以选中该点的颜色,当然一下是不可能完全选中所需要指定的全部区域,可以在未选中的地方接着再点,这样多