Centos下MPI并行计算环境的建立

精品文档---下载后可任意编辑一、配置前的准备工作假设机群是 2 个节点,分别为 c1,c2。1.安装 Linux(CentOS 5.5)系统，并保证每个节点的 sshd 服务能正常启动。笔者并没采纳真实的 2 台机器，而是利用虚拟机(Hyper-v)在一台装有Windows server 2024 R2 系统的机器上安装多个 Linux 系统进行模拟。注意事项：（1）因为笔者采纳，此版本对 gcc、autoconf 等软件包版本要求较高，为避开出错，尽量安装最新的 Linux 系统。（2）在使用 Hyper-v 安装时，会发现进入 Centos 系统后，网卡无法识别的问题。所以在刚创建完虚拟机时，要将原来默认创建的网卡移除，操作“设置硬件添加硬件旧版网络适配器”，这样才可以正常使用。2.为每个节点分配 IP 地址c1:172.20.20.169, 3.配置/etc/hosts 文件，该文件可以实现 IP 地址和机器的对应解析，所有节点的该文件均要按下面的内容修改：172.20.c1172.20.c2同时一定要注销或者删除这一行：127.0.0.1 localhost，否则在用命令同时开启各节点 mpd 服务时，会出现“mpdboot_c1 (handle_mpd_output 412): failed to handshake with mpd on c2; recvd output={}”的错误通过以上配置后节点之间能够通过各节点的机器名称相互访问。例如，可以通过 ping c2 进行测试。注意事项：该测试必须在关闭 Linux 防火墙的条件下进行，否则可能失败。永久生效：chkconfig iptables on/off（重启生效）即时生效：service iptables start/stop（重启失效）二、挂载 NFS 文件系统由于 MPICH 的安装目录和用户可执行程序在并行计算时需要在所有节点保存副本，而且目录要相互对应，每次一个节点一个节点的复制非常麻烦，采纳NFS 文件系统后可以实现所有节点内容与主节点内容同步更新，并自动实现目录的对应。NFS 文件系统使得所有机器都能以同样的路径访问服务器上保存的文件，访问方法如同对本地文件的访问。通常我们会将 MPICH 的安装目录及并行程序存放目录配置为 NFS 共享目录，这样可以省去将文件向各个节点复制的麻烦，大大提高工作效率。NFS 文件系统的配置方法示例如下（我们在 c1 上设置 NFS 服务器，配置需要在 root 用户下完成）。精品文档---下载后可任意编辑1.服务器端配置方法（下面的配置只在主节点进行）（1）/etc/exports 文件配置在文件/etc/exports 中增加以下几行：/root 172.20.20.0/255.255.255.0(rw,sync,no_root_squash,no_subt...