精品文档---下载后可任意编辑流动剪切和力学牵拉作用下 P-选择素/PSGL-1 解离的分子动力学模拟的开题报告开题报告题目：流动剪切和力学牵拉作用下 P-选择素/PSGL-1 解离的分子动力学模拟一、讨论背景炎症是机体免疫系统对外界刺激的一种反应，包括红肿、热痛等症状。它是机体对于内外源性物质的免疫反应，也是许多疾病的共同病理生理基础，如心脑血管疾病、糖尿病、肿瘤等。讨论炎症发生机理及调控关键因素对于临床疾病的防治有重要意义。P-选择素作为粘附分子，参加炎症、血液凝固及癌症等多种生理病理过程。P-选择素主要在血管内皮细胞表面表达，并能识别并结合PSGL-1，从而招募白细胞细胞外迁移和炎症反应。P-选择素和 PSGL-1结合是炎症过程中的关键步骤，因此讨论 P-选择素和 PSGL-1 的结合机理和解离规律对于深化理解炎症发生机理及研发新药物具有重要意义。本讨论拟通过模拟生理条件下流动剪切和力学牵拉作用下 P-选择素和 PSGL-1 的结合状态及解离情况，探究 P-选择素/PSGL-1 粘附作用的力学特征和分子机制，为炎症调控和药物研发提供理论指导和探究新思路。二、讨论内容与技术路线1.构建 P-选择素/PSGL-1 复合物结构模型在已有的 P-选择素和 PSGL-1 结构信息基础上，采纳蛋白质生物物理手段及计算化学方法，构建 P-选择素/PSGL-1 复合结构的原子级模型，保证结构的准确性及生理逼真度。2.分子动力学模拟讨论利用分子动力学方法模拟 P-选择素/PSGL-1 复合物在流动剪切和力学牵拉作用下的结合状态及解离情况，讨论 P-选择素/PSGL-1 粘附作用的力学特征和分子机制。针对不同流动剪切和力学牵拉条件下的 P-选择素/PSGL-1 结合状态，分析复合物内部氢键、疏水作用及电荷相互作用等因素的作用以及相互作用的强度变化情况，解析 P-选择素/PSGL-1 复合物结构特征和粘附行为的动态过程和机理。精品文档---下载后可任意编辑3.数据分析及呈现对模拟数据进行分析和呈现，包括化学分析工具和可视化分析工具，探究 P-选择素/PSGL-1 分子粘附行为的定量变化规律和细节特征，并且与生物实验结果进行对比验证。三、预期成果本讨论拟通过分子动力学模拟讨论清楚而定量地探究 P-选择素/PSGL-1 复合物在生理条件下的结合状态及解离情况，讨论 P-选择素/PSGL-1 粘附作用的力学特征和分子机制。估计可以得到以下成果：1.采纳蛋白质结构建模、生物物理计算及分子动力学模拟，获得 P-选择素/PSGL-1 复合物在流动剪切和力学牵拉...
