转录组RNAseq术语解释VIP专享

RNA-Seq 名词解释1.index测序的标签，用于测定混合样本，通过每个样本添加的不同标签进行数据区分，鉴别测序样品。2.碱基质量值（Quality Score 或 Q-score）是碱基识别（Base Calling）出错的概率的整数映射。碱基质量值越高表明碱基识别越可靠，碱基测错的可能性越小。3.Q30碱基质量值为 Q30 代表碱基的精确度在 99.9%。4.FPKM（Fragments Per Kilobase of transcript per Million fragments mapped）每 1 百万个 map 上的 reads 中 map 到外显子的每 1K 个碱基上的 fragment 个数。计算公式为公式中，cDNA Fragments 表示比对到某一转录本上的片段数目，即双端 Reads 数目；Mapped Reads(Millions)表示 Mapped Reads 总数，以 10 为单位；Transcript Length(kb)：转录本长度，以 kb 个碱基为单位。5.FC（Fold Change）即差异表达倍数。6.FDR（False Discovery Rate）即错误发现率，定义为在多重假设检验过程中，错误拒绝(拒绝真的原(零)假设)的个数占所有被拒绝的原假设个数的比例的期望值。通过控制 FDR 来决定 P 值的阈值。7.P 值（P-value）即概率，反映某一事件发生的可能性大小。统计学根据显著性检验方法所得到的 P 值，一般以P<0.05 为显著，P<0.01 为非常显著，其含义是样本间的差异由抽样误差所致的概率小于 0.05 或 0.01。8.可变剪接（Alternative splicing）有些基因的一个 mRNA 前体通过不同的剪接方式（选择不同的剪接位点）产生不同的 mRNA 剪接异构体，这一过程称为可变剪接(或选择性剪接，alternative splicing)。可变剪接是调节基因表达和产生蛋白质组多样性的重要机制，是导致真核生物基因和蛋白质数量较大差异的重要原因。在生物体内，主要存在 7 种可变剪接类型：A）Exon skipping；B）Intron retention；C) Alternative 5' splice site；D) Alternative 3' splice site；E) Alternative first exon；F) Alternativelast exon；G) Mutually exclusive exon。9.外显子跳跃（Exon skipping）外显子在前体 mRNA 剪接形成成熟 mRNA 过程中被跳过，最终没有出现在某些成熟 mRNA 上，这种剪接机制被称为外显子跳跃。10. 内含子保留（Intron retention）前体 mRNA 在剪接形成成熟 mRNA 的过程中，部分内含子被保留下来，这种剪接机制被称为内含子保留。11. 5'或 3'端可变剪接前体 mRNA 在剪接形成成熟 mRNA 的过程中，5'端...