用GraphPad prism 绘制4参数拟合曲线VIP专享VIP免费

用GraphPadPrism30秒拟合sigmoidal药理浓度梯度数据用GraphPadPrism30秒拟合sigmoidal药理浓度梯度数据GraphPadPrism一个强项就是其简单的曲线拟合。本例展示药理学典型的剂量依赖曲线的拟合过程。如果够熟练，30秒即可完成一幅达到发表质量的曲线拟合图，如下图所示：Transformof2011-11-04Plate1刖言首先要理解Prism所用的拟合模型：Y=Bottom+(Top-Bottom)/(l+10Y(LogEC50-X)*HillSlope))。Prism本身拟合时是用线性梯度X,而实验中一般log梯度，因此需要先将log梯度转换成线性梯度。这些操作均可在Prism里完成。以下是实验数据：Con.(nM)DrugCtrl2025261282629345473910110123134301751902001002622492553002812902751000340280270通常对照组写为0,但在log转换中log0=-inf。因此将Ctrl当作最低实验浓度的下一个梯度，这里写为0.3nM。实际操作1.创建新的实验。第一步，新建ProjectFile，如下图所示：*GraphPadPrismFileEdlitViewInsertChangeArrangeWIIPrismFileSheetUndeClipbncX峙NewT0NewPrismProjectFileCtrl+NOpenPrismProjectFileCtrl+0CloseCtrl+W2.选择图表类型⑴先选择table&graph的类型，XY(下图中红色(1),以下例同)。(2)选择数据来源。(3)选择实验数据的重复，这里选3replica。(4)选择画图时的symbol的数据计算方式：MeanandError,Error一般选SEM即可。(5)这样就可创建数据表了。HowanXYtableorqariized'：-1Subcolumns：forreplicatesorerrorvaluesEnterCoumniContingencyRecentp『oiectHelen：ted口rapri：Availableanalyses・Linearregresdon・匚ubiuspline&LOWESS・Norilin&arre口rwmgioFi・Smoothcurve・Correlation(PearsonorSpearman)・AreaundercurveOrganizationofdatatableX.JSampledataaStartwithanempt'r1datUsesampledataChoose忌graphGroupiedOpenedproject§avedexampleSharederanipiePointsonlubar:E加引H：已「『口rY-alue?2pluthorisont-alerrurbars■：Enterandplot白:■:irialeY■■■■l.dluefore-jchpointreplicatevaluesin$ids-b'ri-$ideSLibcnlurrinj：..3.数据录入。⑴点选DataTables下的表格，可以重命名为：2011-11-04Plate1。(2)输入实验所使用的浓度。(3)输入PlateReader读出的数据。这里为3复孔实验。(4)如果想在一幅图画多条曲线，可继续在此输入新数据，如Drug2。(5)此处可进行浓度变换。4.浓度变换(1)(1)选择要进行变换的数据。(2)选择进行transform。最后点击确定。AnalyzeDataBuilt-inanalysis0Transform,Normalize...[V]A:Drug1⑴TransJormNormshe5.浓度变换(2)(1)选择转换方程。(2)我们这里进行log转换。Whichanalysis?An^lvzewhichd^tasets?0榔IIG星is-QFamilyGLJ加TTJWM口IrfeioPrpfKti^laORHVJH〈1)念Twbofm时mH划Pirn1IT-LIC«P-h=址j5011-11-04PI血丄QtrJHU■呦辈IVi『4醪血述|_>^Y££a*时剧创qDeiifcjrtmtmdcedmpMisieA1T1AiY2i画.一3扁闽—23.F-sra^ne^en:MonlinMtr在底部选择经典拟合方法：Leastsquaresfit。其他方法有机会再详加介绍。Fittingmethod□L&astsquares[ordirsry]fitRobustfitAutomaticoutliereliMinstiori现在即可点确定进行曲线拟合。7.拟合结果。(1)在表...Nonlinfitoftransformof2011-11-14Plate1里，显示所有结果。(2)EC50已经自动计算好，并转换到实验的浓度单位，此单位与所输入数据使用同一单位，这里是nM。(3)这里所使用的模型是经典的四因子模型sigmodial(Hillmodel)，所以会有Hillslope。8.最终图，经过简单修饰。Transformof2011-11-04Plate1eV/rndov?Help；OGraptni卜国讨Transfci來1Pri$mn-[Prc^舸tJjNbdinfitQ!Transfomnof2D11-1L-Ct4Pl^te1]Sheet"undo"'diptodrd企強XTX烬u白恤.电邛・I冉IS7SSDatavuitriResults显2011-11-MPlate!:-QProjectinfoL[二L-ayouts匚齐FloatingNloteENonintitADrug11log(a^onist)vsnespanse-VanaWeslopevalues3BVUOTH14.564Top2^8.9LogEC5G1.266SHilltop?1.025(3)EC50一”1A.46⑵Span2S4.19Std.ErrOf|'10Bittern545211Top5822结束语到此结束。其间有很多选项可以选择，有机会再做介绍。如果够熟练，30秒完成一幅图应该比较简单。Ccn.(nM)