PCR 反应体系中各种成分的作用 不同模板浓度的实验结果 用相同的引物、两种不同的模板,对 6 种不同模板量进行PCR扩增,发现在模板量<25ng的条件下,扩增产物强度相应减弱,大约到2ng左右时无扩增产物;当模板量在25ng~200ng之间时,扩增产物基本稳定,条带清晰、稳定,分辨率高;当模板量>200ng时,会出现大片段扩增产物的缺失或无扩增产物,且点样孔至泳道会出现相应增强的弥散背景。综合考虑,在25μ l的PCR反应体系中,模板DNA以25~ 100ng为最适用量。同时模板DNA在200ng以下不影响扩增结果,但为降低TE缓冲液中EDTA对反应体系中Mg 2+的不良影响程度,应该尽量降低DNA模板用量。 不同Mg2+浓度时实验结果 设置不同Mg2+浓度,当Mg2+浓度为1 0mM时,无PCR扩增产物;Mg2+浓度为1 5~ 2 5mM时,随着Mg2+浓度的增加,PCR扩增产物带型基本一致,但以2 0mM的扩增效果最好 不同引物浓度对PCR结果的影响 设置5 种不同浓度的引物进行PCR扩增,当引物浓度在0 1~ 0 2μ M时,扩增结果基本一致;但随着引物浓度的逐渐增加,开始出现弥散背景增强的趋势,并且有些扩增带发生减弱或缺失。为了保证反应结果的稳定性和特异性,引物浓度以0 .2μ M左右为宜。 不同dNTP浓度对PCR结果的影响 采用2 种引物(OPB17、OPA16),分别以4 种不同的dNTP浓度进行PCR反应,发现dNTP浓度在100μ M、 150μ M、 200μ M、 300μ M时,随着浓度的减小,扩增带明显减少或扩增强度减弱,当dNTP浓度<200μ M时,扩增产物丰富、清晰、带浓,扩增片段产率与dNTP浓度呈正相关。综合考虑,以 100~ 200μ M的dNTP浓度为佳。 TaqDNA聚合酶对扩增结果的影响 设置5 个梯度的TaqDNA聚合酶浓度,结果表明随着TaqDNA聚合酶浓度的增高,扩增产物量呈增多趋势。在0 5u~2 5u浓度间均有扩增产物,但随着TaqDNA聚合酶浓度增加的同时,弥散背景也相应增强。综合考虑,TaqDNA聚合酶浓度以1 0~ 1 5u 结果较好 不同退火温度下的扩增效果 引物用OPD16和OPA01,按照优化的PCR反应体系将退火温度分别设置为33℃、36℃、39℃、42℃。结果表明随着退火温度降低,非特异性产物增加,有弥散背景;退火温度升高,特异性相对增加。 Mgcl2 与dNTP互相作用及对PCR反应的影响 用同一引物OPD07、相同模板DNA比较3 种Mg ...