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核酸环介导等温扩增技术原理和引物设计和实例VIP免费

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核酸环介导等温扩增技术原理及引物设计与实例1.LAMP 引物的设计:LAMP 引物的设计主要是针对靶基因的六个不同的区域,基于靶基因3’ 端的 F3c、F2c 和 Flc 区以及 5’ 端的 Bl、B2 和 B3 区等 6 个不同的位点设计4 种引物。FIP(Forward Inner Primer) :上游内部引物,由 F2 区和 F1C 区域组成, F2 区与靶基因 3’端的 F2c 区域互补, F1C 区与靶基因 5’端的 Flc 区域序列相同。F3 引物:上游外部引物 (Forward Outer Primer) ,由 F3 区组成,并与靶基因的 F3c 区域互补。BIP 引物:下游内部引物 (Backward Inner Primer ),由 B1C 和 B2 区域组成,B2 区与靶基因 3’ 端的 B2c 区域互补, B1C 域与靶基因 5’端的 Blc 区域序列相同。B3 引物:下游外部引物 (Backward Outer Primer ),由 B3 区域组成,和靶基因的 B3c 区域互补。如图所示:2.扩增原理60— 65℃是双链 DNA 复性及延伸的中间温度 ,DNA 在 65℃左右处于动态平衡状态。因此,DNA 在此温度下合成是可能的。利用4 种特异引物依靠一种高活性链置换 DNA 聚合酶。使得链置换DNA 合成在不停地自我循环。扩增分两个阶段。第 1 阶段为起始阶段 ,任何一个引物向双链DNA 的互补部位进行碱基配对延伸时,另一条链就会解离,变成单链。上游内部引物FIP 的 F2 序列首先与模板F2c结合(如图 B 所示),在链置换型 DNA 聚合酶的作用下向前延伸启动链置换合成。外部引物 F3 与模板 F3c 结合并延伸,置换出完整的FIP 连接的互补单链(如图C所示)。FIP 上的 F1c 与此单链上的 Fl 为互补结构 。自我碱基配对形成环状结构 (如图 C 所示)。以此链为模板。下游引物BIP 与 B3 先后启动类似于FIP 和 F3 的合成,形成哑铃状结构的单链。迅速以3’末端的 Fl 区段为起点.以自身为模板,进行DNA 合成延伸形成茎环状结构。该结构是LAMP 基因扩增循环的起始结构。第 2 阶段是扩增循环阶段。以茎环状结构为模板,FIP 与茎环的 F2c 区结合。开始链置换合成,解离出的单链核酸上也会形成环状结构。迅速以3’末端的 B1 区段为起点,以自身为模板。进行DNA 合成延伸及链置换.形成长短不一的2 条新茎环状结构的 DNA ,BIP 引物上的 B2 与其杂交。启动新一轮扩增。且产物DNA长度增加一倍。在反应体系中添加2 条环状引物 LF 和 LB,它们也分别与茎环状结构结合启动链置...

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