ABI3500操作手册基因测序

ABI 3500 操作手册3500/3500XL 简易操作手册1.空间定位和光谱校正1.1 设置 Dye Set进入 library 界面，选择 Dye Sets 菜单，点击 Create，在Dye Set Name 中输入“AGCU_E5”作为我公司 Dye Set 名称，从 Chemistry下拉菜单中选择“Matrix Standard”，从 Dye Set Template下拉菜单中选择“E5Template”，设置完成后点击 Save 保存设置。1.2 空间定位进入 3500 Data Collection Software主界面，选择 Maintenance菜单，在 Maintenance 界面中点击 Calibrate 下拉菜单中的 Spatial 按钮，选择合适的空间定位参数即可开始空间定位。3500 系列遗传分析仪空间定位与3100、3130 系列类似。 x/xABI 3500 操作手册1.2 光谱校正 a、光谱校正前先更换水和阴阳极 Buffer，按 10ul 甲酰胺：0.5ul5 Dye Matrix Standard 的比例配制甲酰胺和光谱校正标准品混合物，轻轻震荡混匀后短暂离心。准备一块新的 96 孔反应板，将配制好的混合物均匀的分装在前三列各孔中。3500/3500xL 进行光谱校正时仪器默认第一个 Run，即前三列中加入了光谱校正混合物。95℃加热 3 min ，立即冰浴 3 min，变性完成后装载 96 孔板并置于仪器托盘中。b、点击 Calibrate 下拉菜单中的 Spectral 按钮，按照图示选择各种参数点击 Start Run 即可进行光谱校正。注意在 Dye Set 中应选则在 1.1 中设置好的与 AGCU 试剂盒相匹配的 Dye Ste。如果光谱校正未达到仪器默认质量要求，仪器会自动重复跑样三次，并自动选择各次跑样中质量最好的通道作为此次光谱校正的最后结果。光谱校正时应观察实时原始数据，以便及时做出相应调整，确保最终结果。C、3500系列遗传分析仪与 3100、3130 系列遗传分析仪最大的区别之一就是光谱校正。它不需要编写 protocol、run module 等软件栏目及其相应参数设置，直接按照仪器默认的参数进行即可，因此操作更为简单、快捷。 x/xABI 3500 操作手册2.软件参数设置2.1 创建 Instrument Protocol进入 library 界面，选择 Instrument Protocols 菜单，点击 Create。按下图所示选择或设置各个参数，设置完成后点击 Save 保存。注意将 Protocol Name 命名为“AGCU_E5_STR”，进样电压设置为 3kv，进样时间可设置为 6～10 sec，Dye Set 选择 1.1 步骤中已设置好的“AGCU_E5”，其他参数设置请参照下图。 x/xABI 3500 操作手册2.2 创建 Size Standard进...