精品文档---下载后可任意编辑微卫星标记（microsatellite），又称为短串联重复序列(short tandem repeats，STR)或简单重复序列（simple sequence repeats，SSR），是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列，由 2~6 个核苷酸的串联重复片段构成。由于重复单位的重复次数在个体间呈高度变异性并且数量丰富，因此微卫星标记的应用非常广泛。微卫星位点通常通过 PCR 扩增，扩增产物通过电泳分析，并根据大小分离等位基因进行检测。由于单个微卫星位点重复单元在数量上的变异，个体的扩增产物在长度上的变化就产生长度的多态性，这一多态性称为简单序列重复长度多态性(SSLP)，每一扩增位点就代表了这一位点的一对等位基因。由于 SSR重复数目变化很大，所以 SSR 标记能揭示比 RFLP（限制性内切酶片段长度多态性）高得多的多态性，这就是 SSR 标记的原理。技术特点（1）数量丰富，覆盖整个基因组，揭示的多态性高；（2）具有多等位基因的特性，提供的信息量高；（3）以孟德尔方式遗传，呈共显性（假如双亲的性状同时在 F1 个体上表现出来，即一对等位基因的两个成员在杂合体中都表达的遗传现象称为共显性），可鉴定出纯合子和杂合子；（4）实验重复性好，结果可靠。每个位点由设计的引物顺序决定，便于不同的实验室相互沟通合作开发引物。应用范围（1） 遗传杂交育种（2） 绘制染色体遗传图谱（3） DNA 指纹和品种鉴定（4） 种质资源保存和利用（5） 基因组关联分析经典案例案例一题目：SSR linkage map construction and QTL identification for plant height and ear height in Maize（玉米 SSR 连锁图谱构建与株高及穗位高 QTL 定位）主要技术：SSR 分型技术流程：文章摘要：用玉米自交系组合 R15×掖 478 的 F2 群体构建连锁图谱，并通过 1 年 2 点随机区组试验设计，考察玉米 229 个 F2：4 家系成株期的株高和穗位高。所建连锁图谱上共拟合 146 个 SSR 标记位点，覆盖基因组 1666cM，标记间平均距离为 11．4cM。用复合区间作图法进行 QTL 分析，共检测到 8 个控制株高的 QTL，分别位于第 2、3、4．5 和 8 染色体；3 个控制穗位高的 QTL 位点，位于第 4 染色体。单个株高QTL 的贡献率变幅为 6．67％-11．59％，单个穗位高 QTL 贡献率变幅为 10．46％-12．15％。案例二题目：利用 SSR 技术对黄瓜新品种津优 35 号进行种子纯度鉴定主要技术：SSR 分型技术流程...
