微生物群落多样性测序与功能分析VIP专享

.. 微 生 物 群 落 多 样 性 测 序 与 功 能 分 析 微 生 物 群 落 测 序 是 指 对 微 生 物 群 体 进 行 高 通 量 测 序 ，通 过 分 析 测 序 序 列 的 构成 分 析 特 定 环 境 中 微 生 物 群 体 的 构 成 情 况 或 基 因 的 组 成 以 及 功 能 。借 助 不 同 环 境下 微 生 物 群 落 的 构 成 差 异 分 析 我 们 可 以 分 析 微 生 物 与 环 境 因 素 或 宿 主 之 间 的 关系 ， 寻 找 标 志 性 菌 群 或 特 定 功 能 的 基 因 。对 微 生 物 群 落 进 行 测 序 包 括 两 类 ，一 类是 通 过 16s rDNA， 18s rDNA， ITS 区 域 进 行 扩 增 测 序 分 析 微 生 物 的 群 体 构 成 和 多样 性 ； 还 有 一 类 是 宏 基 因 组 测 序 ， 是 不 经 过 分 离 培 养 微 生 物 ， 而 对 所 有 微 生 物DNA 进 行 测 序 ， 从 而 分 析 微 生 物 群 落 构 成 ， 基 因 构 成 ， 挖 掘 有 应 用 价 值 的 基 因 资源 。 以 16s rDNA 扩 增 进 行 测 序 分 析 主 要 用 于 微 生 物 群 落 多 样 性 和 构 成 的 分 析 ，目 前 的 生 物 信 息 学 分 析 也 可 以 基 于16s rDNA 的 测 序 对 微 生 物 群 落 的 基 因 构 成 和代 谢 途 径 进 行 预 测 分 析 ， 大 大 拓 展 了 我 们 对 于 环 境 微 生 物 的 微 生 态 认 知 。 目 前 我 们 根 据16s 的 测 序 数 据 可 以 将 微 生 物 群 落 分 类 到 种 （ species） （ 一般 只 能 对 部 分 菌 进 行 种 的 鉴 定 ） ， 甚 至对 亚种 级别进 行 分 析 ， 几个概念： 16S rDNA（ 或16S rRNA） ：16S rRNA 基 因 是 编码原核生 物 核糖体 小亚基 的基 因 ， 长度约为1542bp， 其分 子大 小适中 ， 突变率小， 是 细菌 系 统分 类 学 研究中 最常用 和 最有 用 的 标 志 。 16S rRNA 基 因 序 列 包 括9 个可 变区 和10 个保守区 ，保守区 序 列 反映了 物 种 间 的 亲缘关 系 ，而 可 变区 序 列 则能 体 现物 种 间 的 差...