代谢工程重点整理一、名词解释1、柔性节点(flexible node):若流入每一分支得流量容易改变以满足需求,这样得节点称为柔性节点
(在柔性节点,导向每一分支得酶对节点代谢物得亲与性相近似,每个分支得反应速度也相近,每一分支得流量受相应得终端产物反馈抑制控制
)2、刚性节点:若一个节点得一个或多个分支得分配率被严密控制,则称该节点就是强刚性得,即刚性节点
(这种控制通常就是通过反馈控制与一个代谢物对另一个分支得酶得交叉激活这两种作用得结合来实现得
)3、反馈抑制(feedback inhibition):也称负反馈,这就是生物体普遍存在得一种调节机制,反馈抑制就是指反应终产物对自身合成途径中得酶活力起抑制作用,大多就是对第一个酶得活力起抑制作用
4、反馈阻遏:末端代谢产物阻止整个代谢途径酶得合成作用
5、代谢组学:一门“在新陈代谢得动态进程中,系统讨论代谢产物得变化规律,揭示机体生命活动代谢本质”得科学
它所关注得就是相对分子质量为 1,000 以下得小分子
6、拟稳态假设:7、超定系统与不定系统:AX(t)=0,假如方程数等于反应速率数目(代谢通量),方程有唯一确定解,称为正定系统
假如方程数小于反应速率数目(代谢通量),方程有无数解或不确定解,称为不定系统
假如方程数大于反应速率数目,称为超定系统
假如已测量得通量得个数小于系统得自由度,刚对网络通量存在无数个解不定系统,这时假如能够规定一个合适得目标函数(例如使比生长速率最大这样得目标函数),那么就能利用线性规划来确定胞内通量分布
8、比较基因组学(parative genomics):在基因组图谱与序列分析得基础上,对已知基因与基因得结构进行比较,了解基因得功能、表达调控机制与物种进化过程得学科
9、基因尺度得代谢网络构建:代谢网络模型得构建包含有序地收集生物系统内所有基因、蛋白质、生物化学反应得信息得过程,然后
