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RNA的提取和cDNA合成原理和实验方法

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RNA 得提取与c DNA 合成原理与实验方法第一节、 概述从真核生物得组织或细胞中提取 mR N A,通过酶促反应逆转录合成c DNA 得第一链与第二链,将双链c DN A与载体连接,然后转化扩增, 即可获得 cD N A 文库,构建得cDNA 文库可用于真核生物基因得结构、表达与调控得分析;比较 c D NA 与相应基因组 DN A 序列差异可确定内含子存在与了解转录后加工等一系列问题。总之 c DN A 得合成与克隆已成为当今真核分子生物学得基本手段。自 70 年代中叶首例 cDNA 克隆问世以来,已进展了许多种提高 cDNA 合成效率得方法,并大大改进了载体系统,目前 cDNA 合成试剂已商品化。cDNA 合成及克隆得基本步骤包括用反转录酶合成 cD N A 第一链,聚合酶合成 cDN A 第二链,加入合成接头以及将双链 DNA 克隆到于适当载体(噬菌体或质粒)。一、RN A 制备模板 mR NA得质量直接影响到 c D NA 合成得效率。由于 mRNA 分子得结构特点,容易受 RN A酶得攻击反应而降解,加上 R N A 酶极为稳定且广泛存在,因而在提取过程中要严格防止 RNA 酶得污染,并设法抑制其活性,这就是本实验成败得关键。所有得组织中均存在 RNA 酶,人得皮肤、手指、试剂、容器等均可能被污染,因此全部实验过程中均需戴手套操作并常常更换(使用一次性手套)。所用得玻璃器皿需置于干燥烘箱中 2 0 0℃烘烤2小时以上。凡就是不能用高温烘烤得材料如塑料容器等皆可用 0、1%得焦碳酸二乙酯(DEPC)水溶液处理,再用蒸馏水冲净。DEP C就是 R N A 酶得化学修饰剂,它与 RNA 酶得活性基团组氨酸得咪唑环反应而抑制酶活性。DEP C 与氨水溶液混合会产生致癌物,因而使用时需小心。试验所用试剂也可用 DEPC 处理,加入 D E P C至 0、1%浓度,然后剧烈振荡 10 分钟,再煮沸 15 分钟或高压灭菌以消除残存得DE PC,否则 D E PC 也能与腺嘌呤作用而破坏m R NA活性。但 DEPC 能与胺与巯基反应,因而含 Tri s与 DTT 得试剂不能用D EP C处理。Tris 溶液可用DEP C 处理得水配制然后高压灭菌。配制得溶液如不能高压灭菌,可用D EP C处理水配制,并尽可能用未曾开封得试剂。除 D E PC 外,也可用异硫氰酸胍、钒氧核苷酸复合物、RNA 酶抑制蛋白等。此外,为了避开 mRNA 或 cDNA 吸附在玻璃或塑料器皿管壁上,所有器皿一律需经硅烷化处理。细胞内总 RN A制备方法很...

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