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泛素化蛋白质组

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一、叶片总蛋白的提取消化1、取 2 g 叶片,在研钵中加入液氮充分研磨,然后转到离心管中,加入 30 ml 预冷的含有10% TCA 和 0.07% DTT 的丙酮,充分混匀后在-20°C 沉淀过夜。2、4°C,35000 g 离心 1 h 后,弃上清。加入 30 ml 预冷的含有 0.07% DTT 的丙酮,充分混匀后置于-20°C 中 1h。4°C,35000 g 离心 1 h,弃上清。3、用 30 ml 预冷的含有 0.07% DTT 的丙酮洗涤沉淀 2 次,最后打开管盖风干,尽量使残留的丙酮挥发洁净。4、取适量裂解液(20Mm HEPES pH8.0,8M Urea,2.5mM 焦磷酸钠,1mMβ-甘油磷酸盐,50uM PR-169)溶解蛋白粉末。5、25000 g,4°C 离心 30 min 后,收集上清,即为蛋白,如上清含有杂质可再离心一次,定量测定蛋白含量后置于-80°C 或进行下一步操作。本实验采纳考马斯亮蓝法(Bradford 法)测定蛋白质浓度,用 BSA 作为标准液,在 96 孔板中加入相应的 BSA 标准蛋白以及考马斯亮蓝试剂。BSA 浓度(ul)0.20.40.60.81.01.21.41.62.02.43.0100 μg/ml 标准蛋白(μl)0.81.62.43.244.85.66.48.09.612H2O(μl)39.238.437.636.836.035.234.433.632.030.428.0按顺序将上述标准蛋白加入 96 孔板,同时,将 5μl 待测蛋白液,95 μl 的考马斯亮蓝试剂混匀后加入 96 孔板,三次重复,避光静置 5-10 min 后,置于分光光度计下测定在 595 nm 处的吸光度,取 595 nm 处吸光值与对应标准蛋白浓度制作标准曲线,并计算待测样品的浓度。 6. 加 1/278 体积(36ul/10ml 蛋白提取物)的 1.25M DTT 至蛋白上清液,混合均匀,置于55 30min℃; 7. 冰浴使温度恢复至室温(不能太冰会沉淀); 8. 加 1/10 体积(1ml)碘乙酰胺溶液,混匀,室温避光 15min; 9. 用 20mM HEPES PH8.0 稀释蛋白液 1:4 倍(30ml/10ml 蛋白提取物),至尿素终浓度至 2M; 10. 加 1/100 体积(100ul)的 1mg/ml trypsin-TPCK,室温过夜(37℃培育箱 14-18h); 二、裂解肽段的纯化1. 在样品中加 1/20 体积(2ml)的 20% TFA 至 终浓度为 1%进行酸化,用 pH 试纸条测 pH< 3。冰浴 15min,生成沉淀; 2. 室温 5000g 离心 15min,取上清至新的 50ml 离心管; 3. 把 10ml 的注射器安装到 Sep-Pak 柱的短端,5ml 100% 乙腈预湿;4. 用 1ml,3ml,6ml Solvent A(0.1%TFA)依次过柱清洗;5. 加入酸化的酶解产物(样品);6....

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