盐地碱蓬内生中度嗜盐菌的分离与系统发育多样性分析VIP专享VIP免费

微生物学通报FEB20,2010,37(2):204−210MicrobiologyChina©2010byInstituteofMicrobiology,CAStongbao@im.ac.cn基金项目：山东省自然科学基金项目(No.Y2007D40);山东大学微生物技术国家重点实验室开放课题基金项目*通讯作者：Tel:86-531-86182573;:zhijiexia08@163.com收稿日期：2009-07-29;接受日期：2009-09-21研究报告盐地碱蓬内生中度嗜盐菌的分离与系统发育多样性分析崔春晓戴美学夏志洁*(山东师范大学生命科学学院山东济南250014)摘要:为了了解东营滨海盐地碱蓬植株内生中度嗜盐菌的多样性,采用传统分离鉴定技术和基于16SrRNA序列分析对样品中可培养细菌的多样性进行研究。根据其生理生化特征、16SrRNA序列测定和系统发育分析,分离获得的15株内生菌可分为4个类群,涉及Halomonadaceae科的Chromohalobacter属、Kushneria属、Halomonas属以及Bacillaceae科的Bacillus属。类群I中4菌株的16SrRNA序列与Chromohalobacterisraelensis的最高相似性为95%。类群II共7株菌,归属于Kushneria属,是碱蓬内生中度嗜盐菌中的优势类群。类群III菌株的16SrRNA序列与一株尚无明确分类地位的Gammaproteobacteria亚门耐盐固氮细菌Haererehalobactersp.JG11的相似性为99%。类群IV中的芽孢杆菌的16SrRNA序列与已知细菌的相似性为96%,很可能代表了Bacillus属的新种。各种水解酶类的分析表明,在分离的15株菌中有3株菌产蛋白酶,14株产酯酶,8株产DNA酶,11株产半乳糖苷酶,14株产脲酶。研究结果揭示,盐地碱蓬中存在较为丰富的中度嗜盐菌多样性和系统发育多样性,并且潜藏着较多的新的微生物类群。关键词:中度嗜盐菌,盐地碱蓬,系统发育分析PhylogeneticDiversityofEndophyticModeratelyHalophilicBacteriaIsolatedfromSuaedasalsaL.CUIChun-XiaoDAIMei-XueXIAZhi-Jie*(CollegeofLifeScience,ShandongNormalUniversity,Jinan,Shandong250014,China)Abstract:Thetraditionalisolationandidentificationmethodandanalysisbasedon16SrRNAsequenceswereusedtoinvestigatethephylogeneticdiversityofendophyticmoderatelyhalophilicbacteriaofSuaedasalsaL.inDongying.Accordingtophysiologicalandbiochemicalcharacteristics,16SrRNAsequencesandphylogeneticanalysis,15isolatedendophyticbacterialstrainswereclassifiedintofourgroups,belongingtogeneraChromohalobacter,Kushneria,HalomonasorBacillusseparately.16SrRNAsequencesof4strainsinGroupIhadthehighestsimilaritytoChromohalobacterisraelensis(95%).GroupIIwhichcontained7strainsofthegenusKushneriaisthedominantgroupinSuaedasalsaL..ThestrainsinGroupIIIbeartheclosestaffiliationtoHaererehalobactersp.JG11(99%),whichisnotclassifieddefinitely.Theonlyen-崔春晓等:盐地碱蓬内生中度嗜盐菌的分离与系统发育多样性分析205http://journals.im.ac.cn/wswxtbcndospore-formingbacteriumwasclassifiedintogroupIV.Its16SrRNAsequencesimilaritieswithrespecttotheknownBacillusspecieswere≤96%,whichwaspresumedtobepotentialnovelspecies.Amongtheseisolatedstrains,3strainsproducedproteinase;14strainsproducedesterase;8strainsproducedDNase;11strainsproducedgalactosidase;14strainsproducedurease.Theresearchresultsindicatedthattherewasnotonlyabundantphylogeneticdiversityofmoderatelyhalophilicbacteria,butalsosomeunknownbacteriagroupsexistedinSuaedasalsaL..Keywords:Moderatelyhalophilicbacteria,SuaedasalsaL.,Phylogeneticanalysis中度嗜盐菌(Moderatelyhalophilicbacteria)是不同于古生菌的,在NaCl浓度为3%−15%之间有最佳生长的一类细菌,广泛存在于盐湖、盐场、沙漠、高盐土壤和盐渍食物等各种环境[1−3]。广义的中度嗜盐菌也包括细菌中一些极端耐盐的种类[4]。自1988年提出Halomonadaceae科分类单元以来[5],该科已经成为中度嗜盐菌最主要的科,目前Halomonadaceae科包含7个属共74个种(但本科中属、种的变动很大,其中50%以上的种至少被重新分类和命名过一次)。中度嗜盐菌属极端微生物,具有许多其他生物所没有的生...