用2-△△Ct法分析real-timePCR数据-----联合应用LightCyclerDataAnalysis软件和MSExcelBynetmee,netmee@163
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1、打开存取的数据文件,点击2、依次点击,,这是适合SYBRgreen为染料的选项
点击step1:Baseline下的“changegraphsettings”小图标
取消弹出的CustomizeGraph选项卡中的Logarithmis选项,点击“OK”按钮,退出选项卡
3、点击下的“changegraphsettings”小图标,取消弹出的CustomizeGraph选项卡中的Logarithmis选项,点击“OK”按钮,退出选项卡
4、在选项卡中拖动红色标记线,选取个条曲线都为直线上升部位
5、可以在选项卡中观察是否需选取的是曲线直线上升部分
观察绿线部分与S型曲线交叉的部分是否为直线
6、如果确为直线,则左侧的“CrossingPoint”值为所需要的Ct值
7、依次选取下图菜单:将数据导出为文本文件
8、打开所保存的文本文件,如图选取9、将数据粘贴入新建的excel文件,“CrossingPoint”列即是Ct值,删除“Standard”和“CalculatedConcentration”列
10、将目的基因,本例中为“iNOS”的Ct值按标本对应剪切入beta-actin值右侧一列
分别标记两列数据为“beta-actin”和“iNOS”
11、设置所有Ct值的单元格格式12、数字选项卡,分类选择为数值,点击确定
13、将E列(目的基因Ct值右侧一列)输入公式“=D4-C4”,求出目的基因与同管beta-actinCt值之差,即△Ct
14、向下拉复制公式,将△Ct列数值计算出
15、在△Ct列右侧一列插入公式“=POWER(2,(0-E4))”,此即目的基因相对bet