STR 常见问题、原因及解决方法讨论整理 stu tter 产物 1、 什么是 stu tter 产物? stu tter 产 物 又 被 称 为 影 子 带 , 或 者DNA 聚 合 酶 滑 脱 产 物 。(复制链错配假说)PCR 产 物 比主要扩增产 物 少一个重复单位。 2、 产生机制 DNA 复制过程中的滑 动, 或 DNA 复制和修复时滑 动链与互补链碱基错配, 导致一个或 几个 重复单位的缺失或 插入造成。 DNA 复制过程中,因为 子 带 链的插入或 模板链的脱 落导致的引物 一模板复合 物 的一个区域在引物延伸的过程中发生错配, 此时引物 或 者 模板滑 脱 导致一个重复单位形成碱基非配对环。 (a)在 复 制 过 程 中 重 复 区 域DNA 双 链 很 容 易 彼 此 解 开 。 由 于 每 个 重 复 单 位 相 同 , 在 双 链 重 新 复 性 时 可 能 会 不 按 照 配对 顺 序 , 从 而 发 生 一 个 重 复 单 位 的 错 位 。(b)如 果 在 延 伸 过 程 中 新 合 成 链 凸 出 一 个 重 复 单 位 , 则 会 在 下 一 轮 复 制 过 程中 增 加 一 个 重 复 单 位 形 成 插 入 。(c)反 过 来 讲 , 如 果 在 模 板 链 凸 出 一 个 重 复 单 位 , 则 新 合 成 的 链 就 比 全 长STR 等 位基 因 短 一 个 重 复 单 位 。 这 种 情 况 发 生 的 频 率 与 侧 翼 序 列 、重 复 单 位 及待扩增 等 位 基 因 的 长 度有关。 总的 来 说, 四核苷酸 STR 基 因 座 stu tter 产物出 现频 率 小于 15%, 在 分型图谱中 表现为一 个 比 STR 等 位 基 因 短 一 个 重 复 单 位 的 小峰。 3 、 表现状态 1、通常比 相 应的 主要等 位 基 因 小一 个 重 复 单 位 , 或多一 个 重 复 单 位 2、一 般小于 相 应等 位 基 因 峰高的 15%。 3、stu tter 的 量取决于 基 因 座、PCR 条件以及所用的 聚合 酶。 4、随重 复 单 位 的 增 长 stu tter 产物有减少的 倾向。 (五核苷酸重 复 <四核苷酸重 复 <三核苷酸重 复 <二核苷酸重 复 ) 5、在 一 个 基 因 座内较大等 位 基 因 的 stu tter 产物量更多。 6、 序 列 重 复 不 完 全 时 , stu tt...