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VectorNTI中文使用说明书

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精品文档---下载后可任意编辑软件包中文翻译者:宋厚辉(浙江大学)前言(Introduction)1.程序附带的数据库(Vector NTI database)包括:DNA/RNA、蛋白质、内切酶、寡核苷酸、凝胶mark。此外程序还提供数据库开发(Database Explorer)功能,用户可以自己修改、添加、拷贝感兴趣的各类数据库。2.创建新分子(有四种方法)A.用 GenBank/GenPept, EMBL/SWISS-PROT and FASTA、ASCII 等格式输入 DNA 或氨基酸。B.手工粘帖,然后保存到数据库中C.从其他分子、接头、载体中剪切、拼接构键D.从 DNA 或 RNA 分子的编码区翻译成蛋白质3.关于新分子的序列特征图谱:利用 GenBank/GenPept, EMBL/SWISS-PROT or FASTA 等格式输入的分子都能显示出序列和结构图,但自己手工粘帖的没有,需要自己编辑第一章 Chapter 1Tutorial: Display Windows(显示窗口)目的:创建显示窗口,并对图、序列和文本进行操作Vector NTI安装后首次登录,系统将提示是否允许填充空库,点 OK。这样 DNA molecules, proteins, enzymes, oligos, and gel markers 将组成 NTI 的数据库。并出现下列两个窗口。2. 观察出现的 Vector NTI 工作窗口和 Database Explorer 窗口上面的第一个窗口为工作窗口,由菜单栏和工具条两栏,移动鼠标到工具栏任意选项处,鼠标自动显示每个工具条的功能。第二个窗口为 exlporing——local vector NTI database,显示的是上次打开的 DNA/RNA 或蛋白分子。3. Create a Display Window for pBR322激活 exlporing——local vector NTI database 窗口中的 DNA/RNA Molecules (MAIN) 数据库,找到 pBR322 分子并双击打开。显示如下窗口:精品文档---下载后可任意编辑4. 观察 pBR322 显示窗口上面的窗口由文本区(对分子信息的文字描述,双击文件夹可以看到)、图形区(标住限制性内切酶位点等)和序列区(全序列及酶切位点)三个部分组成。5. 显示窗口的管理(通过拖拉标尺,改变窗口、或每个显示区的相对大小)6. 转换 pBR322’s 图形区:在工具栏左边的 active pane 右侧有三个按钮,用鼠标点当中那个(graphics pane)7. 对 pBR322’s 结构图进行操作:用户可以尝试点击、、,此时图形的大小会发生变化。选区设定:菜单 Edit——>set selection,输入 100bp–1000bp’端,可以看到,通过拖拉可以延长或缩短选区范围,同样在 3’端也能做到。假如用户一次...

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