X－tile 软件的操作流程 由于最近在做某基因表达与预后相关性的分析，对如何选择最佳cutoff值很疑惑.搜了丁香园的各大帖子，发现对x—tile如何使用并没有人分享过。经过对比软件中的操作说明，终于搞明白是怎么回事了,现分享给大家! 首先，将你excel表格中的“某基因的表达值”“生存期"“删失情况”等等其他一些数据复制到文本文档中。注意：“删失情况”要写成“censored”, “uncensored”， or “unknown” 形式. 然后打开软件(软件下载见附件），如图点击“Analyze"进入下图：点击“file”-—"open"打开刚建的“txt”文本，接着就可以进行设置了.如下图扩大来看!(下图）将“删失情况” 即图中的 DOD—censor,放入”censor”中, 然后将“inter type” 改为"DeadOfDiese”；将“生存期”即图中的”Followup—months”放入“Survival Time”,j 将“inter type” 改为你所用的时间度量，如“天”或“年";将“表达量"即图中的”HER2”放入“Marker1”， Mark2 假如没有可以不填。剩余的也可以不填。然后点左上角的“do”，选择”Kaplan-Meier”-“Marker1”。即可。接着会出现下如图所示结果。鼠标左键点击“2Pop X-tile Plot”所指的矩形图，软件会自动找到最佳的 cutoff 值，得到两条线(两组：高表达－低表达)。鼠标左键点击“3Pop X—tile Plot”所指的三角形，软件会自动找到最佳的 cutoff 值，得到三条线（三组:高表达－中度表达－低表达）.条形图下的 X 轴所指的数值即是最佳 cutoff 值。其余可以参照软件里的指南。写的比较业余，希望能够给大家一些帮助。
