X－tile 软件的操作流程 由于最近在做某基因表达与预后相关性的分析,对如何选择最佳cutoff值很疑惑
搜了丁香园的各大帖子，发现对x—tile如何使用并没有人分享过
经过对比软件中的操作说明，终于搞明白是怎么回事了，现分享给大家
首先,将你excel表格中的“某基因的表达值"“生存期"“删失情况”等等其他一些数据复制到文本文档中
注意：“删失情况"要写成“censored”， “uncensored”, or “unknown” 形式
然后打开软件（软件下载见附件），如图点击“Analyze”进入下图:点击“file”——"open”打开刚建的“txt”文本，接着就可以进行设置了
如下图扩大来看
（下图)将“删失情况" 即图中的 DOD-censor，放入”censor"中， 然后将“inter type" 改为”DeadOfDiese”；将“生存期”即图中的”Followup—months”放入“Survival Time"，j 将“inter type" 改为你所用的时间度量，如“天”或“年”;将“表达量”即图中的”HER2"放入“Marker1”, Mark2 假如没有可以不填
剩余的也可以不填
然后点左上角的“do”，选择”Kaplan—Meier”—“Marker1”
接着会出现下如图所示结果
鼠标左键点击“2Pop X-tile Plot”所指的矩形图，软件会自动找到最佳的 cutoff 值,得到两条线（两组：高表达－低表达）
鼠标左键点击“3Pop X-tile Plot"所指的三角形，软件会自动找到最佳的 cutoff 值，得到三条线（三组:高表达－中度表达－低表达）
条形图下的 X 轴所指的数值即是最佳 cutoff 值
其余可以参照软件里的指南
写的比较业余，希望能够给大家一些帮助
