单晶结构解析加氢,绘图问题解答

1. 通常，H 原子的处理方法作者要给出 (1)一般通过理论加H，其温度因子为固定值，可通过INS 等文件查看 (2) 水分子上H 原子可通过Fourier syntheses 得到 (3)检查理论加上的H 原子是否正确，主要看H 原子的方向。若不正确则删去再通过Fourier syntheses 合成得到 (4) 检查H 原子的键长、键角、温度因子等参数是否正常。通过检查分子间或分子内的H 键是否合理最易看出H 键的合理性 (5) 技巧：有时通过Fourier syntheses 得到的H 原子是正确的，可一计算其温度因子等参就变得不正常，则可以固定其参数后再精修（如在 INS 中的该 H原子前用 afix 1,其后加afix 0） （6）各位来说说方法与心得？ 2. 胡老师，下面的问题怎么解决啊？谢谢您。 220_ALERT_2_B Large Non-Solvent C Ueq(max)/Ueq(min) ... 3.70 Ratio 222_ALERT_3_B Large Non-Solvent H Ueq(max)/Ueq(min) ... 4.97 Ratio 342_ALERT_3_B Low Bond Precision on C-C bonds (x 1000) Ang ... 49 B 级提示当然得重视了。建议你先把 H 撤消，精修到 C 的热椭球不太变形和键长趋正常。 如做不到就要看空间群？衍射点变量比太小？以至追查到原始数据的录取参数和处理等。 这些粗略意见仅供参考，如何？ 3. 在 XP 中画图时，只有一部分，想长出另外的对称部分。我是envi 完了，然后 sgen 长出来的，可是和 symm 显示的对称信息不一样。比如：我根据 envi的结果用 sgen O1 4555 得到的是O1A 而不是O1D，这跟文献中标注的不一样啊，怎么统一呢？很困扰，忘达人指教。 xp 里是按顺序编号的，第一个 sgen 出的的统一为A,依次标号。你如果想一开始就统一D 的话，重新 name 一下 4. 高氯酸根怎么精修呀？我用的SHETXL6.1 版的，最好告诉我怎么用其中的XSHELL 来做，我觉得他好用！ Method 1DFIX Dfix 1.42 0.02 Cl1 O1 Cl1 O2 Cl1 O3 Cl1 O4 Dfix 1.42 0.02 O1 O2 O1 O3 O1 O4 O2 O3 O2 O4 O3 O4 Method 2SADI Sadi 0.01 Cl1 O1 Cl1 O2 Cl1 O3 Cl1 O4 Sadi 0.01 O1 O2 O1 O3 O1 O4 O2 O3 O2 O4 O3 O4 5. 晶体的无序是怎么造成的呀，是晶体培养的问题吗？ 如果无序太多，在解单晶的时候怎么办？我指的是很多的点，没有结构，他们的峰值都大于了 0.5 大于 0.5 没什么的，解完后都在 1 以下就可以了。特殊的比较大的在重原子附近也没...