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基因工程实验1.动物细胞DNA提取原理是什么答:先用SDS裂解细胞,使染色体离析,蛋白质变性,释放出核酸。然后用等体积酚/氯仿/异戊醇抽提,使蛋白质变性沉降到酚与水相的界面,DNA则留在水相中,离心后在上清液中加入醋酸钠和两倍体积无水乙醇,除去多糖物质和沉淀DNA,然后离心后沉淀用70%乙醇洗涤,最后用ddH2O溶解沉淀DNA,-20℃保存。2.DNA提取中用到了哪些试剂?有什么作用?EDTA:二价金属离子螯合剂,螯合Mg2+,抑制DNA酶活性。因为Mg离子是DNA酶的辅因子。SDS:一种阴离子去污剂,在高温(55℃—65℃)条件下能裂解细胞,使染色体离析,蛋白质变性,释放出核酸。酚:使蛋白质变性。氯仿:作为除杂剂,除去糖、脂等杂质;加速有机相与液相分离;抽提核酸溶液中残留的酚。乙丙醇:作为消泡剂;降低DNA的水溶性,让DNA从溶液中析出;有利于分层,使离心后的上层含DNA水相,中间的蛋白质相及下层有机溶液相维持稳定。无水乙醇:降低DNA的水溶性,沉淀DNA。醋酸纳:调PH,中和Tri-Buffer,形成中性环境,利于DNA沉淀。Tri-Buffer(PH8.0):提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏。70%乙醇:清洗溶液中离子及其他杂质。NaCl:提供高盐环境,使DNA溶解于液相中。2.有机溶剂使用注意事项?答:①有机溶剂的容器,不论是否在使用中,都应随手盖紧。②尽可能在通风位置工作,以避免吸入有机溶剂的蒸汽。③尽可能避免皮肤直接接触。3.PCR原理?答:将目的基因DNA在高温(94℃)下解链成为单链模板;人工合成的一对与目的基因两侧序列相互补的寡核苷酸引物在低温(40~60℃)下分别与变性的目的基因片段两侧的两条链的部分序列互补结合;在中等温度(65~75℃)下,由耐热的DNA聚合酶(Taq酶)将dNTP,,,中的脱氧单核甘酸加到引物3-OH末端,并以此为起点,沿着模板以5→3方向延伸,合成一条新的互补链。4.PCR类型?反转录PCR怎么做的答:反向PCR、巢式PCR、锚定PCR、数字PCR、RT-PCR、实时荧光定量PCR、免疫捕捉PCR等。RT-PCR的原理:提取组织或细胞中的总RNA,以ployA(A)+选择性RNA为模板采用oligo(dT)、随机引物或基因特异性的引物GSP经反转录酶的作用从RNA合成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR扩增,获得目的基因或检测基因表达。5.PCR影响因素?答:引物;模板;DNA聚合酶;Mg2+;底物;反应缓冲液。6.PCR体系有什么物质?作用?答:①引物:是两段与待扩增目的DNA序列侧翼片段具有互补碱基特异性的寡核苷酸,使,DNA聚合酶以其3-OH末端为起点合成互补链,决定了特定基因的扩增。②模板:提供DNA复制的模板,模板DNA可以是单链分子,也可以是双链分子。,③TaqDNA聚合酶:将dNTP中的脱氧单核甘酸加到引物3-OH末端,并以此为起点,沿,,着模板以5-3方向延伸,合成一条新的互补链。④底物dNTPmi某:4种脱氧核苷酸,提供PCR反应的原料和能量。⑤反应缓冲液:反应缓冲液一般含有Tri-HCl、KCl和适当的Mg2+。Mg2+是DNA聚合酶的激活剂,Tri-HCl起缓冲作用,KCl有利于引物的退火。7.怎样提高PCR产物的特异性?引物:a.典型的引物18到24个核苷长。引物需要足够长,保证序列独特性,并降低序列存在于非目的序列位点的可能性。但是长度大于24核苷的引物并不意味着更高的特异性。较长的序列可能会与错误配对序列杂交,降低了特异性,而且比短序列杂交慢,从而降低了产量。b.选择GC含量为40%到60%或GC含量映像模板GC含量的引物。c.设计5'端和中间区为G或C的引物。这会增加引物的稳定性和引物同目的序列杂交的稳定性。d.避免引物对3'末端存在互补序列,这会形成引物二聚体,抑制扩增。e.避免3'末端富含GC。设计引物时保证在最后5个核苷中含有3个A或T。f.避免3'末端的错误配对。3'端核苷需要同模板退火以供聚合酶催化延伸。g.避免存在可能会产生内部二级结构的序列,这会破坏引物退火稳定性。Mg2+:浓度通常为0.5—2.0mmol/l,过高或过低均影响产物的特异性。模板:模板量应适宜,过量则可能增加非特异性。延伸时间:应适宜,时间过长会导致产物非特异性增加。循环次数:一般为30个(25—30个)周期,如果循环次数过高,会增加非特异性产物及其复杂度。8.PCR都有哪些酶可以用?答:TaqDNA聚合酶;TthDNA聚合酶;Vent...

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