单细胞测序在表观遗传学中的应用单细胞测序（singlecellsequencing）是指先分离纯化单个细胞，并提取该细胞的DNA或RNA进行扩增后测序的技术1
该技术起步虽不太久，但已深受关注，被竞相用于研发和生产、医用2
相比于宏观组织样品的测序，单细胞测序对于细胞和组织的异质性具有更加明确的分辩，当然，难度也更高
由于在某些组织或研究领域（如癌症、干细胞池等），细胞处于显著的动态发展中，细胞与细胞间差异巨大，而后续的显著变化（如成瘤、分化等）、组织的异质性，往往来源一个细胞克隆；而另一方面，利用表观遗传学（epigenetics）这种非基因组核酸序列的功能差异，研究某一组织生理病理变化，具有极大的必要性3
此时，如果笼统考察组织块的表观遗传学改变，很容易模糊了幂律分布下细胞水平的差异4
相反，结合单细胞测序技术，可着眼于癌症、干细胞等早期的表观遗传学变化，对于理解病因、早期诊断、晚期控制极具价值
尽管分离纯化单细胞难度较高，而且DNA的表观遗传修饰很难通过传统的聚合酶扩增（通常表观遗传学测序方法包括BS-seq和ChIP-seq），因此，单细胞测序用于表观遗传学分析，在技术上极具挑战5
但目前已有研究者在不同领域做出了可喜进展
例如，基于BS-seq的方法中，Guo等利用一种reducedrepresentationbisulfitesequencing(scRRBS)方法，可在一个小鼠胚胎干细胞中的整个基因组范围内，灵敏地检测高达150万个CpG位点，并用该方法进行了单细胞表观遗传测序
该方法用于肿瘤发生、胚胎发育等领域，在各时间点DNA甲基化的动态变化，极具前景6
再如，基于ChIP-seq的方法中，AssafRotem等结合微流控和DNA特征码技术进行了数千个单细胞测序，观察了单细胞水平上传统转录分析无法获取的表观遗传学异质性7
此外，Kantlehner等基于甲
