鳄蜥线粒体基因组全序列及其结构分析VIP专享

鳄蜥线粒体基因组全序列及其结构分析摘要：采纳 PCR 扩增方法测定了鳄蜥关键词：鳄蜥（ShinisauruscrocodilurusAhl.）；线粒体基因组；控制区MitochondrialGenomesofShinisauruscrocodilurusandItsStructureQINPing-sheng，TAOChun-rong，SHEYing，HOULi-xia，YANGXiao-wen，WUZheng-jun，QINXin-min（CollegeofLifeScience，GuangxiNormalUniversity/GuangxiKeyLaboratoryofRareandEndangeredAnimalEcology，Guilin541004，Guangxi，China）Keywords：ShinisauruscrocodilurusAhl.；mitochondrialgenome；controlregion鳄蜥（ShinisauruscrocodilurusAhl.）隶属有鳞目鳄蜥科（Shiniasuridae）鳄蜥属（Shinisaurus），为独科独属独种动物，分布于中国广东、广西以及越南北部[1]。鳄蜥为第四纪冰川末期残留下来的古老爬行类动物，有“活化石之称”，其分类地位非常特别，因此其在爬行纲动物的起源、演化和分类等方面的讨论上，有着重要的学术价值。近年来，由于人为捕捉，栖息环境被污染、破坏，鳄蜥种群数量急剧下降，目前在我国已不足 1000 只，已处于极度濒危的状况，被国家列为Ⅰ级保护动物，并被列入濒危物种国际贸易公约（ConventiononInternationalTradeinEndangeredSpecies）附录Ⅱ。目前，关于鳄蜥的讨论主要集中在物种资源调查、生态、行为、生理和繁殖等方面[1-6]。动物线粒体 DNA 是讨论物种系统发育、种群遗传变异和分化、起源与进化的有效遗传标记。试验测定了鳄蜥的线粒体基因组全序列，以期为鳄蜥的遗传结构、起源进化以及种质资源保护等相关讨论提供分子信息。1 材料与方法1.1 材料鳄蜥死亡个体尾部肌肉。1.2 基因组 DNA 的提取基因组 DNA 的提取参照汪永庆等[7]的方法。1.3 引物的设计参考爬行动物通用引物扩增12SrRNA、16SrRNA、ND2、ND3、COI、COIII、ND5、ND6 和 Cytb 基因的部分片段，根据上述片段的测序结果，利用 Primer5.0 软件设计引物，用以扩增短片段之间的长片段序列，所用引物见表 1。1.4PCR 扩增测序2.2 蛋白质编码基因3 小结目前，国内外有关鳄蜥的讨论主要集中在生态、行为、生理、和人工饲养等方面。本讨论分析了鳄蜥线粒体基因组全序列，包括了 13 个蛋白质编码基因、22 个 tRNA 基因、2 个 rRNA 基因和 1 个控制区（D-loop）。结果表明，鳄蜥线粒体基因组中基因的组成、顺序、编码链的选择、tRNA的结构都与爬行动物相同或相近。结果可为鳄蜥的分类、进化和系统发育等方面提供分子依据。