宏基因组学概述

宏基因组学概述王莹,马伊鸣(北京交通大学 土木建筑工程学院 环境 1402 班)摘 要:随着分子生物学技术得快速进展及其在微生物生态学与环境微生物学讨论中得广泛应用,促进了以环境中未培育微生物为讨论对象得新兴学科——微生物环境基因组学(又叫宏基因组学、元基因组学,英文名 Metagenomics)得产生与快速进展。宏基因组学通过直接从环境样品中提取全部微生物得DNA,构建宏基因组文库,利用基因组学得讨论策略讨论环境样品所包含得全部微生物得遗传组成及其群落功能.在短短几年内,宏基因组学讨论已渗透到各个领域,包括海洋、土壤、热液口、热泉、人体口腔及胃肠道等,并在医药、替代能源、环境修复、生物技术,农业、生物防备及伦理学等各方面显示了重要得价值。本文对宏基因组学得主要讨论方法、热点内容及进展趋势进行了综述关键词: 宏基因组 宏基因组学 环境基因组学 基因文库得构建Macro summary of MetagenomicsWang Ying, Ma YiMing (BeijingJiaotongUniversity, Institute of civil engineering,)Key words: Metagenome; Metagenomics; The environmental genomics宏基因组学(Metagenomics)又叫微生物环境基因组学、元基因组学。它通过直接从环境样品中提取全部微生物得DNA,构建宏基因组文库,利用基因组学得讨论策略讨论环境样品所包含得全部微生物得遗传组成及其群落功能。它就是在微生物基因组学得基础上进展起来得一种讨论微生物多样性、开发新得生理活性物质(或获得新基因)得新理念与新方法。其主要含义就是:对特定环境中全部微生物得总DNA(也称宏基因组,metagenomic)进行克隆,并通过构建宏基因组文库与筛选等手段获得新得生理活性物质;或者根据rDNA数据库设计引物,通过系统学分析获得该环境中微生物得遗传多样性与分子生态学信息。1、起源宏基因组学这一概念最早就是在1998年由威斯康辛大学植物病理学部门得Jo Handelsman等提出得,就是源于将来自环境中基因集可以在某种程度上当成一个单个基因组讨论分析得想法,而宏得英文就是"meta",具有更高层组织结构与动态变化得含义。后来伯克利分校得讨论人员Kevin Chen与Lior Pachter将宏基因组定义为"应用现代基因组学得技术直接讨论自然状态下得微生物得有机群落,而不需要在实验室中分离单一得菌株"得科学。2 讨论对象宏基因组学(Metagenomics)就是将环境中全部微生物得遗传信息瞧作一个整体自上而下地讨论微生物与自然环境或生物体之间得关系。宏基因组学不仅克服了...